More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl556 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl556  uridine monophosphate kinase  100 
 
 
238 aa  480  1e-135  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.982144  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0374  uridylate kinase  77.64 
 
 
237 aa  380  1e-105  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  43.46 
 
 
241 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  43.83 
 
 
238 aa  199  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  43.4 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  43.59 
 
 
244 aa  195  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  44.07 
 
 
240 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  41.88 
 
 
240 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  43.16 
 
 
240 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  41.88 
 
 
240 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  46.7 
 
 
240 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  44.07 
 
 
247 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  42.74 
 
 
245 aa  190  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  42.31 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  41.45 
 
 
240 aa  189  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  41.53 
 
 
247 aa  188  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2974  uridylate kinase  43.28 
 
 
249 aa  188  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  41.53 
 
 
247 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  42.55 
 
 
242 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  41.88 
 
 
263 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  41.88 
 
 
241 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  40.08 
 
 
242 aa  186  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  41.45 
 
 
241 aa  186  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  45.65 
 
 
239 aa  185  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  42.37 
 
 
241 aa  185  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  42.37 
 
 
241 aa  185  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  42.13 
 
 
234 aa  184  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  43.4 
 
 
245 aa  184  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  41.95 
 
 
245 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  41.95 
 
 
241 aa  184  9e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3163  uridylate kinase  42.37 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  40.76 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  41.03 
 
 
241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  42.37 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  42.02 
 
 
241 aa  182  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  41.95 
 
 
247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  40.59 
 
 
242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  41.95 
 
 
247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  41.53 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  39.74 
 
 
245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  40.34 
 
 
247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  41.88 
 
 
246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00169  uridylate kinase  42.44 
 
 
241 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0505974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3432  uridylate kinase  42.44 
 
 
241 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0174185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0181  uridylate kinase  42.44 
 
 
241 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000366692  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0182  uridylate kinase  42.44 
 
 
241 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0585328  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0164  uridylate kinase  42.44 
 
 
241 aa  182  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0156878  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3489  uridylate kinase  42.44 
 
 
241 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.257153  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0175  uridylate kinase  42.44 
 
 
241 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0173  uridylate kinase  42.44 
 
 
241 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120351  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3358  uridylate kinase  41.6 
 
 
241 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.386876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  41.6 
 
 
241 aa  181  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  42.13 
 
 
238 aa  181  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  40.34 
 
 
247 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  40.34 
 
 
246 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1047  uridylate kinase  43.57 
 
 
257 aa  180  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.309878  normal  0.307589 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  42.02 
 
 
255 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0243  uridylate kinase  42.02 
 
 
241 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  41.1 
 
 
247 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0240  uridylate kinase  42.02 
 
 
241 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.432338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0709  uridylate kinase  41.6 
 
 
241 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  40.68 
 
 
252 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0240  uridylate kinase  42.02 
 
 
241 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351644  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0258  uridylate kinase  42.02 
 
 
241 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0256  uridylate kinase  42.02 
 
 
241 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  41.53 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  42.86 
 
 
241 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  41.28 
 
 
240 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  40.34 
 
 
243 aa  178  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  39.41 
 
 
242 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  42.86 
 
 
241 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  42.48 
 
 
239 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  42.55 
 
 
241 aa  178  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  41.6 
 
 
241 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  41.35 
 
 
245 aa  178  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  40.6 
 
 
236 aa  178  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  40.17 
 
 
239 aa  177  9e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  41.77 
 
 
239 aa  177  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  41.1 
 
 
235 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  43.83 
 
 
238 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4268  uridylate kinase  37.18 
 
 
259 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0793924  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  41.3 
 
 
245 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  41.18 
 
 
247 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  40.6 
 
 
240 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  40.76 
 
 
237 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  40.76 
 
 
237 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  40.76 
 
 
237 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  42.98 
 
 
239 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  40.93 
 
 
245 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  40.76 
 
 
237 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  40.76 
 
 
237 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  40.76 
 
 
286 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  40.93 
 
 
245 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2979  uridylate kinase  41.35 
 
 
243 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  40.93 
 
 
245 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  41.88 
 
 
242 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  40.76 
 
 
237 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  40.93 
 
 
245 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  43.64 
 
 
237 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  40.17 
 
 
234 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>