More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0068 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0068  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
122 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl601  50S ribosomal protein L7/L12  68.85 
 
 
122 aa  137  6e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 
126 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  46.34 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  53.33 
 
 
119 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  46.34 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  45.9 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  44.26 
 
 
121 aa  94  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  53.54 
 
 
126 aa  92  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  49.18 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  42.62 
 
 
121 aa  90.5  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  52.07 
 
 
122 aa  90.1  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  45.97 
 
 
125 aa  90.1  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 
122 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0568  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  51.22 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf211  50S ribosomal protein L7/L12  50.83 
 
 
123 aa  88.2  4e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  48 
 
 
124 aa  87.4  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 
124 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0314  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  87  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000853139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  50.83 
 
 
124 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  47.66 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  47.66 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  48 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  48.03 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  47.24 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4064  50S ribosomal protein L7/L12  45.9 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112087  hitchhiker  0.00864262 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  47.58 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  47.62 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0192  50S ribosomal protein L7/L12  45.9 
 
 
121 aa  84.3  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000934048  hitchhiker  0.00053412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  49.6 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0188  50S ribosomal protein L7/L12  45.9 
 
 
121 aa  84.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000136924  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4474  50S ribosomal protein L7/L12  45.9 
 
 
121 aa  84.3  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  42.86 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  52.1 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  52.1 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  48.78 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4325  50S ribosomal protein L7/L12  47.15 
 
 
122 aa  84.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000520258  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3593  50S ribosomal protein L7/L12  47.58 
 
 
123 aa  84  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4698  50S ribosomal protein L7/L12  47.15 
 
 
122 aa  84  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000163845  hitchhiker  0.00000529046 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  46.83 
 
 
128 aa  84  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  47.24 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  46.4 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0413  50S ribosomal protein L12P  47.2 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291542  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  47.58 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2263  50S ribosomal protein L7/L12  45.6 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2177  ribosomal protein L7/L12  44.88 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.866659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3035  50S ribosomal subunit protein L7/L12  45.6 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  45.6 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  47.54 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  46.83 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  44.96 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  43.65 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  49.19 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  49.17 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  46.77 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  47.54 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  47.54 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0011  50S ribosomal protein L7/L12  47.5 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.492576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  44.26 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  47.54 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3861  50S ribosomal protein L7/L12  44.17 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000856877  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  42.19 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  47.54 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0338  50S ribosomal protein L7/L12  44.17 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  48.39 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  46.34 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3315  50S ribosomal protein L7/L12  48 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801397  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2968  50S ribosomal protein L7/L12  48 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  40.31 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  49.18 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0597  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0210666  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  43.8 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1416  50S ribosomal protein L12P  45.9 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000264913  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3190  50S ribosomal protein L7/L12  49.6 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2867  50S ribosomal protein L7/L12  43.44 
 
 
121 aa  80.1  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346272  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0191  50S ribosomal protein L7/L12  47.58 
 
 
123 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000396495  hitchhiker  0.00119483 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  39.52 
 
 
121 aa  80.1  0.000000000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1301  50S ribosomal protein L7/L12  49.18 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0017753  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0150  ribosomal protein L7/L12  46.34 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000840717  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0186  50S ribosomal protein L7/L12  47.58 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00287299  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0191  50S ribosomal protein L7/L12  47.58 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000969343  hitchhiker  0.000734412 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0196  50S ribosomal protein L7/L12  43.44 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000850088  normal  0.220465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>