29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3029 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3029  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  294  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.355709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  57.14 
 
 		 358 aa  144  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  33.09 
 
 		 430 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  29.5 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  28.72 
 
 		 533 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  35.16 
 
 		 441 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  31.75 
 
 		 434 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  32.65 
 
 		 646 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  28.79 
 
 		 649 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  30.3 
 
 		 386 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  28.79 
 
 		 556 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  32.99 
 
 		 538 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  34.07 
 
 		 588 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  32.65 
 
 		 441 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  30.95 
 
 		 436 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  29.17 
 
 		 566 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  30.16 
 
 		 566 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  31.39 
 
 		 602 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  27.66 
 
 		 529 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  29.85 
 
 		 559 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  30.69 
 
 		 687 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  30.93 
 
 		 662 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  28.28 
 
 		 452 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  28.28 
 
 		 412 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  29.93 
 
 		 651 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  32.41 
 
 		 581 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  31.13 
 
 		 560 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  36.54 
 
 		 618 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  31.07 
 
 		 499 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>