More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1938 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  100 
 
 		 441 aa  883    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  40.83 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  38.75 
 
 		 459 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  38.75 
 
 		 459 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  38.75 
 
 		 459 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  38.75 
 
 		 459 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  38.75 
 
 		 459 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  43.82 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  38.75 
 
 		 1093 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 448 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  44.44 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  37.95 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 455 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 445 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 445 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  39.68 
 
 		 438 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 455 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  39.91 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  43.88 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  39.91 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  39.91 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  39.91 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  39.91 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  39.91 
 
 		 438 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  39.91 
 
 		 438 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  38.93 
 
 		 455 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  40.24 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.41 
 
 		 433 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  41.99 
 
 		 443 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.93 
 
 		 433 aa  259  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 450 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 454 aa  246  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 448 aa  246  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  38.67 
 
 		 478 aa  242  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  38.67 
 
 		 478 aa  242  9e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  39.77 
 
 		 448 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 448 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 448 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 475 aa  236  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  36.75 
 
 		 471 aa  233  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  36.34 
 
 		 471 aa  226  6e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3457  putative signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 453 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.805731  normal  0.295467 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  36.07 
 
 		 471 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  35.36 
 
 		 487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 449 aa  217  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 524 aa  217  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 480 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5327  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 480 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.446982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  39.3 
 
 		 499 aa  216  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 461 aa  216  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  39.81 
 
 		 501 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  33.94 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  41.08 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  34.3 
 
 		 517 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 531 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  40.06 
 
 		 463 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  40.8 
 
 		 526 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 458 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  32.73 
 
 		 459 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 446 aa  207  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 517 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0275  histidine kinase  40.24 
 
 		 442 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 519 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.91 
 
 		 515 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  35.49 
 
 		 517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 515 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  35.07 
 
 		 439 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5522  Signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5498  two-component regulator system signal sensor kinase PmrB  34.72 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  40.56 
 
 		 509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  36.9 
 
 		 469 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  35.37 
 
 		 505 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  35.37 
 
 		 505 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 450 aa  196  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 517 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  35.79 
 
 		 517 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 517 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  35.45 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  35.41 
 
 		 454 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  36.86 
 
 		 467 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 515 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  35.15 
 
 		 505 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>