32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0915 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  44.33 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  44.28 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  41.92 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  53.45 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  38.5 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  46.34 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  44.72 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  44.8 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  45.83 
 
 		 345 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  38.28 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  45.24 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  45.38 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  37.7 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  36.79 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0947  putative transmembrane protein  30.65 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.972023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0803  hypothetical protein  30.65 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2670  putative transmembrane protein  31.66 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  32.39 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  36.04 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  36.36 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  40.74 
 
 		 185 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  30.21 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03736  ketosynthase  28.21 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  27.72 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  29.45 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  29.45 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  34.41 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  34.41 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  27.47 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  29.87 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>