69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01769 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01769  response regulator receiver protein  100 
 
 		 561 aa  1155    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.4688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1268  response regulator receiver protein  49.7 
 
 		 513 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 538 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02197  response regulator receiver protein  28.63 
 
 		 540 aa  237  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00179351  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0359  putative PAS/PAC sensor protein  22.99 
 
 		 560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1854  response regulator receiver domain-containing protein  22.14 
 
 		 549 aa  137  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.274781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  25.66 
 
 		 551 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  23.19 
 
 		 546 aa  118  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  22.59 
 
 		 546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2318  response regulator receiver protein  27.15 
 
 		 403 aa  114  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0145  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  28.3 
 
 		 449 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4421  response regulator receiver protein  22.54 
 
 		 535 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0768  response regulator/TPR domain-containing protein  21.66 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0795  response regulator receiver protein  21.66 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0809  response regulator receiver protein  21.46 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  22.49 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0477  response regulator receiver domain-containing protein  25.16 
 
 		 537 aa  103  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  26.28 
 
 		 572 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2579  response regulator receiver protein  22.61 
 
 		 547 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0041  response regulator  22.19 
 
 		 535 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  22.81 
 
 		 533 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  23 
 
 		 534 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1169  two component transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 549 aa  99  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1257  response regulator VieB  24.23 
 
 		 553 aa  97.8  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00784807  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06171  hypothetical protein  25.16 
 
 		 555 aa  98.2  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  25.13 
 
 		 540 aa  97.1  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1458  response regulator receiver protein  22.33 
 
 		 416 aa  80.1  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.893415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  22.65 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0947  response regulator receiver protein  20.95 
 
 		 539 aa  69.3  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00824863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1457  response regulator receiver protein  22.33 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  20.8 
 
 		 577 aa  67  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01904  CheY-like receiver protein  17.89 
 
 		 533 aa  62  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.466885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1860  putative response regulator  21.9 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.436307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  29.6 
 
 		 229 aa  51.6  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0533  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25 
 
 		 597 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.985347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  25.44 
 
 		 127 aa  49.3  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2035  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 750 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 		 750 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2389  response regulator receiver domain-containing protein  27.89 
 
 		 159 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.589748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.57 
 
 		 227 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3634  response regulator receiver  21.25 
 
 		 587 aa  48.5  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3251  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.89 
 
 		 341 aa  47.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61058  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2604  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.89 
 
 		 341 aa  47.4  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.224021  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.33 
 
 		 246 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  31.25 
 
 		 1147 aa  47  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  26.96 
 
 		 234 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  26.5 
 
 		 1066 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  25 
 
 		 129 aa  45.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.48 
 
 		 357 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  26.85 
 
 		 635 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  25.33 
 
 		 247 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 222 aa  45.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2600  two component transcriptional regulator  26.87 
 
 		 239 aa  45.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  19.49 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4185  response regulator receiver protein  26.95 
 
 		 159 aa  45.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  26.13 
 
 		 122 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 402 aa  44.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  25.17 
 
 		 245 aa  45.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  28.1 
 
 		 241 aa  44.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3546  putative PAS/PAC sensor protein  23.31 
 
 		 282 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1917  response regulator receiver  24.81 
 
 		 303 aa  44.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  25 
 
 		 129 aa  44.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3798  two component transcriptional regulator  25.68 
 
 		 225 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  23.86 
 
 		 247 aa  44.3  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  25 
 
 		 129 aa  44.3  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  25 
 
 		 129 aa  44.3  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2080  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.36 
 
 		 461 aa  44.3  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  21.26 
 
 		 188 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1861  putative PAS/PAC sensor protein  26.06 
 
 		 280 aa  43.5  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>