224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01328 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01328  alkaline phosphatase  100 
 
 
488 aa  1012    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1216  alkaline phosphatase  59.41 
 
 
429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1963  alkaline phosphatase  50 
 
 
477 aa  408  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  52.17 
 
 
440 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  51.93 
 
 
439 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  51.93 
 
 
425 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  51.93 
 
 
439 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  51.93 
 
 
439 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  49.88 
 
 
455 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0598  alkaline phosphatase  51.34 
 
 
445 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.383819  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  50.61 
 
 
461 aa  378  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  49.56 
 
 
464 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  49.89 
 
 
470 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  49.56 
 
 
464 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1207  alkaline phosphatase  43.72 
 
 
464 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0124836  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  48.25 
 
 
457 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  51.84 
 
 
454 aa  364  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0573  alkaline phosphatase  48.1 
 
 
492 aa  360  4e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.949232  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  50.12 
 
 
543 aa  359  6e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1098  putative alkaline phosphatase  43.34 
 
 
473 aa  351  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.374892  decreased coverage  0.00462057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0989  alkaline phosphatase  45.77 
 
 
480 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.544846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  45.82 
 
 
476 aa  342  7e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  41.52 
 
 
461 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  41.21 
 
 
461 aa  309  9e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  36.62 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  40.78 
 
 
461 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  41 
 
 
461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  41.25 
 
 
461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  40.78 
 
 
461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  40.35 
 
 
461 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  40.13 
 
 
461 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  40.13 
 
 
461 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  39.91 
 
 
461 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  39.91 
 
 
461 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  39.01 
 
 
474 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  39.01 
 
 
474 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  38.11 
 
 
455 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  34.29 
 
 
434 aa  200  6e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  34.52 
 
 
434 aa  199  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  31.25 
 
 
536 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  34.24 
 
 
506 aa  190  4e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  32.85 
 
 
433 aa  187  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  32.54 
 
 
454 aa  180  5.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82654  vacuolar alkaline phosphatase  33.65 
 
 
560 aa  179  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.134835 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10563  alkaline phosphatase Pho8 (AFU_orthologue; AFUA_2G03110)  31.04 
 
 
606 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00384867  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  32.68 
 
 
557 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  33.11 
 
 
557 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  33.18 
 
 
553 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  30.68 
 
 
541 aa  169  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  30.54 
 
 
589 aa  166  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2238  alkaline phosphatase  32.36 
 
 
557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177606  hitchhiker  0.000000857533 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  29.7 
 
 
557 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  29.28 
 
 
537 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  29.29 
 
 
557 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  29.29 
 
 
557 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  32.2 
 
 
548 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  29.14 
 
 
547 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  30.22 
 
 
557 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  29.84 
 
 
436 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  33.64 
 
 
530 aa  159  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  29.65 
 
 
557 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3003  alkaline phosphatase  31.75 
 
 
557 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2292  Alkaline phosphatase  30.63 
 
 
487 aa  153  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  37.42 
 
 
388 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2693  alkaline phosphatase  31.12 
 
 
501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  31.63 
 
 
335 aa  148  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43722  vacuolar alkaline phosphatase  31.68 
 
 
501 aa  146  8.000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.563768  normal  0.0682876 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  30.18 
 
 
525 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0512  Alkaline phosphatase  32.83 
 
 
501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.239781  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1700  Alkaline phosphatase  30.48 
 
 
490 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3187  alkaline phosphatase  28.16 
 
 
468 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  29.94 
 
 
525 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  27.87 
 
 
503 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  28.19 
 
 
481 aa  137  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2472  Alkaline phosphatase  28.4 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000616832  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  30.37 
 
 
426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  30.37 
 
 
464 aa  131  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  27.65 
 
 
450 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  28.33 
 
 
454 aa  131  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  29.92 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1383  Alkaline phosphatase  36.42 
 
 
608 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2447  Alkaline phosphatase  30.04 
 
 
486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  28.61 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2225  Alkaline phosphatase  28.6 
 
 
481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  31.78 
 
 
609 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  29.5 
 
 
558 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  28.71 
 
 
471 aa  127  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0399  Alkaline phosphatase  25.7 
 
 
469 aa  127  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0930  Alkaline phosphatase  26.78 
 
 
537 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  30.79 
 
 
476 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0192  alkaline phosphatase  28.68 
 
 
400 aa  126  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.282333  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  28.68 
 
 
471 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  28.68 
 
 
471 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4018  Alkaline phosphatase  29.7 
 
 
492 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.306331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  28.68 
 
 
471 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  28.68 
 
 
471 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  28.68 
 
 
471 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  28.68 
 
 
471 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4197  alkaline phosphatase  29.27 
 
 
499 aa  125  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  28.43 
 
 
471 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>