More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00656 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  67.77 
 
 
546 aa  773    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  67.41 
 
 
547 aa  783    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  67.41 
 
 
547 aa  783    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  68.52 
 
 
547 aa  795    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  68.86 
 
 
546 aa  786    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  60.55 
 
 
552 aa  691    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  67.22 
 
 
547 aa  783    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  67.96 
 
 
547 aa  785    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  69.23 
 
 
546 aa  780    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  67.89 
 
 
547 aa  790    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  67.77 
 
 
546 aa  773    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  67.95 
 
 
546 aa  774    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  68.13 
 
 
546 aa  776    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  67.41 
 
 
547 aa  783    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  100 
 
 
546 aa  1130    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  68.5 
 
 
546 aa  778    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  67.09 
 
 
550 aa  763    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2032  acetolactate synthase  67.4 
 
 
558 aa  756    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.101383  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  65.38 
 
 
550 aa  775    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  67.96 
 
 
547 aa  785    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  67.95 
 
 
546 aa  771    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  65.38 
 
 
563 aa  758    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  66 
 
 
550 aa  762    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  71.85 
 
 
547 aa  828    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  64.65 
 
 
548 aa  751    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  68.86 
 
 
546 aa  786    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  79.12 
 
 
546 aa  921    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  68.52 
 
 
547 aa  788    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  69.05 
 
 
546 aa  780    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  68.89 
 
 
547 aa  798    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  67.95 
 
 
546 aa  774    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  68.86 
 
 
546 aa  786    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  67.95 
 
 
546 aa  774    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  62.04 
 
 
556 aa  713    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  59.89 
 
 
547 aa  667    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  67.77 
 
 
546 aa  773    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  65.82 
 
 
550 aa  759    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  67.77 
 
 
546 aa  773    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  57.19 
 
 
552 aa  615  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5394  acetolactate synthase  56.65 
 
 
548 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752966  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0778  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  56.39 
 
 
554 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2375  acetolactate synthase  55.1 
 
 
551 aa  593  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373721  normal  0.787639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  54.96 
 
 
546 aa  594  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2397  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  54.74 
 
 
550 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2541  acetolactate synthase  48.26 
 
 
544 aa  535  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7024  hypothetical protein  51.93 
 
 
565 aa  528  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0863974  normal  0.0979808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  43.02 
 
 
545 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  43.61 
 
 
550 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  41.87 
 
 
547 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  43.61 
 
 
550 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  44.03 
 
 
550 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0840  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein TPP-binding protein  43.52 
 
 
547 aa  422  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.923558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  42.34 
 
 
545 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  41.19 
 
 
547 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  40.78 
 
 
544 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0036  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  40.6 
 
 
547 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  40.37 
 
 
583 aa  386  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.78 
 
 
554 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0734  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  42.6 
 
 
526 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1043  acetolactate synthase  38.6 
 
 
583 aa  370  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  37.71 
 
 
547 aa  361  2e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  35.23 
 
 
565 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  35.05 
 
 
562 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  35.49 
 
 
565 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  34.86 
 
 
562 aa  312  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  35.3 
 
 
565 aa  312  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  35.3 
 
 
562 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  35.3 
 
 
562 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  34.86 
 
 
562 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  35.3 
 
 
562 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  35.12 
 
 
562 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3439  acetolactate synthase  34.25 
 
 
559 aa  309  8e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0619  acetolactate synthase  32.71 
 
 
559 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0836  acetolactate synthase  33.02 
 
 
559 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3317  acetolactate synthase  33.27 
 
 
559 aa  302  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1837  acetolactate synthase  33.21 
 
 
553 aa  299  8e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1192  acetolactate synthase  33.09 
 
 
567 aa  299  8e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.37842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3432  acetolactate synthase  34.44 
 
 
561 aa  297  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3840  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.46 
 
 
546 aa  297  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000394  acetolactate synthase catabolic  32.28 
 
 
567 aa  296  7e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000407166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2027  acetolactate synthase  34.57 
 
 
559 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0520  acetolactate synthase  31.82 
 
 
548 aa  290  4e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.778646 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1349  acetolactate synthase  32.68 
 
 
554 aa  287  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0263641  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1703  acetolactate synthase  34.17 
 
 
560 aa  282  1e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.694647  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  34.97 
 
 
622 aa  274  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  31.42 
 
 
558 aa  274  3e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2155  acetolactate synthase  32.22 
 
 
554 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1192  acetolactate synthase  32.12 
 
 
560 aa  273  8.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0417652  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  30.64 
 
 
566 aa  270  5e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  31.87 
 
 
562 aa  270  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.17 
 
 
566 aa  269  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2276  acetolactate synthase  31.23 
 
 
554 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2237  acetolactate synthase  31.23 
 
 
554 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.1 
 
 
563 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  31.71 
 
 
599 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.85 
 
 
557 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.45 
 
 
584 aa  267  2.9999999999999995e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  32.31 
 
 
587 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4128  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.1 
 
 
557 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.33 
 
 
636 aa  267  4e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>