More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6428 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6428  methyltransferase type 11  100 
 
 		 237 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.51 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  33.61 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.46 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3485  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  27.41 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.73 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.2 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.73 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.16 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.73 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.73 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.2 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.63 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  32 
 
 		 309 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  30 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 309 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.21 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  34.95 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28.72 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3644  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.34 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.423854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 624 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2368  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000109502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.04 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  33.04 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 293 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0278  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.65 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.831577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2739  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  31.76 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2360  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175254  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0176  hypothetical protein  35.92 
 
 		 279 aa  52.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  34.82 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  28 
 
 		 293 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1091  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1453  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.49 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00782533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.98 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.41 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1854  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.823258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.6 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.4 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 255 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 250 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2971  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 221 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5114  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.947305 
 
 
-
 
NC_002620  TC0712  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.86 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  45.65 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.21 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.67 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.5 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0146  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.844636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  33.6 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.16 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.21 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.78 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.21 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 310 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1620  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.97 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.62 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0557  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.29 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.21 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.21 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.21 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  32.21 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.6 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6235  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>