50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4189 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  227  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  86.21 
 
 		 116 aa  201  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  57.26 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  57.26 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  58.62 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  66.29 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  43.14 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  34.23 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  45.33 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  44 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  44.3 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  43.04 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  38.75 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  38.67 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  43.42 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  31.07 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5521  chemotactic signal-response protein CheL  37.88 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  36.49 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  36.11 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  36.11 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  28.89 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  37.31 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  35.71 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1505  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.14 
 
 		 430 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.68 
 
 		 400 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  29.07 
 
 		 361 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  32.91 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.68 
 
 		 400 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  32.35 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  31.43 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0248  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.86 
 
 		 310 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  23.53 
 
 		 388 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1008  flagellar protein, putative  29.58 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2405  hypothetical protein  32.81 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3723  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.25 
 
 		 388 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3277  flagellar protein FlgJ-like protein  34.72 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3943  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.58 
 
 		 384 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2842  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  29.49 
 
 		 394 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  0.211592 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3099  hypothetical protein  22.35 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123717  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4382  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.58 
 
 		 384 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4783  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.63 
 
 		 361 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.186683 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  23.61 
 
 		 332 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1473  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.43 
 
 		 384 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2916  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.4 
 
 		 352 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  23.19 
 
 		 605 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3706  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.63 
 
 		 361 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.0583488 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5633  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.14 
 
 		 348 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  24.64 
 
 		 610 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  22 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3643  peptidoglycan hydrolase  25.53 
 
 		 139 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>