20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1008 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1008  flagellar protein, putative  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  32.08 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2003  flagellar protein FlgJ  43.42 
 
 		 560 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  34.04 
 
 		 119 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  40 
 
 		 605 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  32.56 
 
 		 109 aa  50.1  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  31.58 
 
 		 109 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  35.53 
 
 		 610 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  36.71 
 
 		 388 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  32.99 
 
 		 109 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  33.33 
 
 		 135 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  36.59 
 
 		 128 aa  46.2  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  29.58 
 
 		 116 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.51 
 
 		 400 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.51 
 
 		 400 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1898  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.58 
 
 		 399 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  31.88 
 
 		 108 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1485  flagellar protein FlgJ  34.25 
 
 		 379 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.477202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02920  putative flagellar biosynthesis  38.89 
 
 		 316 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1595  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.58 
 
 		 317 aa  41.6  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>