259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3674 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 
138 aa  279  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  77.54 
 
 
138 aa  228  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  73.72 
 
 
138 aa  213  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  76.09 
 
 
138 aa  207  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  76.09 
 
 
138 aa  207  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  66.42 
 
 
139 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  68.12 
 
 
140 aa  198  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  63.04 
 
 
138 aa  189  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  62.77 
 
 
138 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  62.77 
 
 
138 aa  186  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  63.24 
 
 
145 aa  186  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  61.31 
 
 
139 aa  183  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  57.35 
 
 
140 aa  172  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  57.35 
 
 
140 aa  171  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  59.12 
 
 
137 aa  168  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  55.88 
 
 
140 aa  166  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  59.12 
 
 
139 aa  164  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  54.96 
 
 
141 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  54.2 
 
 
141 aa  150  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  52.99 
 
 
141 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  53.12 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  53.12 
 
 
141 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  53.54 
 
 
136 aa  144  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  51.91 
 
 
141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  52.34 
 
 
141 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  51.97 
 
 
136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  49.62 
 
 
139 aa  136  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  48.82 
 
 
135 aa  136  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 
136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 
136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  49.22 
 
 
136 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  46.92 
 
 
137 aa  130  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  50.38 
 
 
135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  46.83 
 
 
134 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
137 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  41.22 
 
 
140 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2601  flagellar basal body rod protein FlgC  43.9 
 
 
126 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.773402  hitchhiker  0.000553357 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.19 
 
 
137 aa  101  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  42.11 
 
 
128 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  42.11 
 
 
126 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 
130 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2111  flagellar basal body rod protein FlgC  41.01 
 
 
130 aa  97.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.3 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.53 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.53 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.17 
 
 
137 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  40.16 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  40.16 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  40.16 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  40.16 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  40.16 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.78 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.97 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.77 
 
 
140 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.04 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  40.16 
 
 
134 aa  90.5  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  40.94 
 
 
130 aa  90.1  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  35 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  34.03 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  38.64 
 
 
141 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.72 
 
 
138 aa  88.6  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  39.37 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.37 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.67 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  39.37 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  39.37 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  39.37 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  39.37 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  39.37 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  40.62 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  39.37 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.78 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.23 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.06 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.5 
 
 
163 aa  87  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.23 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.58 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.96 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  36.09 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  35.88 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  35.88 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4075  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.38 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.402367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  39.37 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  35.88 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  35.88 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  35.88 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  35.88 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  35.88 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  35.86 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  35.86 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  37.01 
 
 
134 aa  84  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  32.08 
 
 
164 aa  84  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  37.01 
 
 
134 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  39.84 
 
 
135 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.84 
 
 
134 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  36.64 
 
 
141 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.62 
 
 
149 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.3 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  36.64 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  36.64 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>