121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1357 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1357  IS30 family transposase  100 
 
 		 210 aa  441  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0153  integrase catalytic subunit  98.57 
 
 		 322 aa  437  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0786  integrase catalytic subunit  99.05 
 
 		 322 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1044  integrase catalytic subunit  98.57 
 
 		 322 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.343683  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1724  integrase catalytic subunit  98.57 
 
 		 322 aa  437  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1916  integrase catalytic subunit  97.14 
 
 		 322 aa  430  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1002  integrase catalytic subunit  83.96 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1584  integrase catalytic subunit  73 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00305908  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1003  hypothetical protein  81.61 
 
 		 87 aa  153  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  29.51 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  29.51 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  29.51 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1090  transposase  28.02 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  28.02 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  28.02 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0454  transposase  28.02 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0164  transposase  28.02 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1466  transposase  28.02 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163454  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  28.02 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  28.02 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0259  transposase  28.02 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  29.36 
 
 		 335 aa  61.6  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  29.36 
 
 		 335 aa  61.6  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  27.8 
 
 		 317 aa  62  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1249  integrase, catalytic region  27.8 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0925898  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0307  IS30 family transposase  33.12 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1130  IS30 family transposase  29.33 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.679883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1133  IS30 family transposase  29.33 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0356  IS30 family transposase  32.08 
 
 		 309 aa  58.2  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1811  IS30 family transposase  32.48 
 
 		 309 aa  58.2  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0574  integrase catalytic subunit  25.65 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000257634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2303  integrase catalytic subunit  25.65 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000160202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1957  integrase catalytic subunit  25.65 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0192  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0304  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0025223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0348  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000266386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0510  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0588  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0692  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0698  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0879  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1206  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1392  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0906223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1496  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1999  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2114  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2153  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2188  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2715  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000216698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3181  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293838  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0648  IS1470, transposase  25.96 
 
 		 350 aa  55.1  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0659  IS1470, transposase  26.61 
 
 		 268 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2401  IS1470 transposase  25.96 
 
 		 350 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000104485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0314  IS1470, transposase  25.96 
 
 		 350 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0321  IS1470, transposase  25.96 
 
 		 350 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0967  IS1470, transposase  25.96 
 
 		 350 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.666025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1078  IS1470, transposase  25.96 
 
 		 350 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1373  IS1470, transposase  25.96 
 
 		 350 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.111224  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  27.8 
 
 		 342 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0628  IS1470, transposase  25.96 
 
 		 350 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.19443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0712  IS1470, transposase  25.96 
 
 		 350 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0379  IS1470, transposase  25.96 
 
 		 350 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.728113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0383  IS1470, transposase  25.96 
 
 		 350 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 313 aa  51.6  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 313 aa  51.6  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 313 aa  51.6  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 313 aa  51.6  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 313 aa  51.6  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1088  IS1470, transposase  25.96 
 
 		 350 aa  51.6  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.958304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  25.94 
 
 		 313 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0128  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.763879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0141  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000388252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0159  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.988546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0496  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1242  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1469  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1712  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2173  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0370565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2716  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000665461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3182  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.815282  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  25.22 
 
 		 339 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 313 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 313 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_62  putative integrase  31.3 
 
 		 321 aa  48.9  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559018  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  25.34 
 
 		 343 aa  48.5  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  26.7 
 
 		 342 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4230  IS30 family transposase  27.03 
 
 		 346 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.382634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  26.44 
 
 		 315 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4284  integrase catalytic subunit  27.21 
 
 		 273 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  24.07 
 
 		 336 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1131  IS30 family transposase  28.79 
 
 		 341 aa  45.1  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  24.88 
 
 		 342 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  24.88 
 
 		 342 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  24.88 
 
 		 342 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  24.88 
 
 		 342 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0245  integrase catalytic subunit  36.46 
 
 		 278 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00234461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>