More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0379 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0314  IS1470, transposase  97.71 
 
 		 350 aa  702    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0321  IS1470, transposase  97.71 
 
 		 350 aa  701    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0379  IS1470, transposase  100 
 
 		 350 aa  718    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.728113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0383  IS1470, transposase  99.43 
 
 		 350 aa  714    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0628  IS1470, transposase  99.71 
 
 		 350 aa  716    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.19443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0648  IS1470, transposase  97.43 
 
 		 350 aa  702    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0712  IS1470, transposase  99.71 
 
 		 350 aa  716    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0967  IS1470, transposase  97.71 
 
 		 350 aa  702    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.666025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1078  IS1470, transposase  98 
 
 		 350 aa  703    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1088  IS1470, transposase  99.14 
 
 		 350 aa  711    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.958304  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1373  IS1470, transposase  98 
 
 		 350 aa  703    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.111224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2401  IS1470 transposase  97.43 
 
 		 350 aa  699    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000104485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0659  IS1470, transposase  96.64 
 
 		 268 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0358  IS1470, transposase  94.94 
 
 		 240 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0540717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0574  integrase catalytic subunit  51.59 
 
 		 347 aa  343  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000257634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1957  integrase catalytic subunit  51.59 
 
 		 347 aa  343  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2303  integrase catalytic subunit  51.59 
 
 		 347 aa  343  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000160202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  50.43 
 
 		 356 aa  338  8e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0692  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0588  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0510  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2188  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3181  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2715  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000216698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1496  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1392  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0906223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2153  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2114  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1999  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0698  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1206  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0879  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0192  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0304  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0025223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0348  integrase catalytic subunit  50.14 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000266386  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1578  IS1470, transposase  96.62 
 
 		 154 aa  299  6e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000377469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2716  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000665461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3182  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.815282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1469  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1712  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0496  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2173  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0370565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1242  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0128  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.763879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0141  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000388252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0159  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.988546  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0140  ISTde2, transposase  35.26 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1022  ISTde2, transposase  35.26 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0477791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1752  ISTde2, transposase  35.26 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0660  IS1470, transposase  98.67 
 
 		 75 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0555532  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1130  IS30 family transposase  32.82 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.679883  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1133  IS30 family transposase  32.82 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_62  putative integrase  32.23 
 
 		 321 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 386 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  31.96 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  31.96 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  31.96 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  31.96 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  31.96 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  31.96 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  31.96 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  30 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  30 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  30 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  30 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  30 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  30 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  30 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  30 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  30 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  30.54 
 
 		 457 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  32.54 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  31.55 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  31.85 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  31.85 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  31.85 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  31.85 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  31.64 
 
 		 354 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  32.24 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  32.24 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  27.62 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  30.56 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  30.56 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  29.73 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  31.2 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  31.02 
 
 		 386 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  32.04 
 
 		 386 aa  133  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1131  IS30 family transposase  30.56 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  32.04 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  31.74 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  31.74 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  31.74 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  31.74 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  31.74 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  31.74 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  31.74 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  31.74 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  31.74 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  31.74 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  31.74 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>