More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0245 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0245  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 278 aa  567  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00234461  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1130  IS30 family transposase  45.52 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.679883  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1133  IS30 family transposase  45.39 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1811  IS30 family transposase  36.94 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0307  IS30 family transposase  36.94 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0356  IS30 family transposase  36.94 
 
 		 309 aa  163  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1612  IS30 family transposase  71.88 
 
 		 160 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0574  integrase catalytic subunit  32.88 
 
 		 347 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000257634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1957  integrase catalytic subunit  32.88 
 
 		 347 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2303  integrase catalytic subunit  32.88 
 
 		 347 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000160202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  35.85 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  135  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3181  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0510  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1206  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2715  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000216698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2188  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1496  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2153  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0588  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0879  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0698  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0692  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1392  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0906223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2114  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1999  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0192  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0304  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0025223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0348  integrase catalytic subunit  33.22 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000266386  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  35.97 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  35.97 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  35.97 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1088  IS1470, transposase  31.51 
 
 		 350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.958304  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0379  IS1470, transposase  31.16 
 
 		 350 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.728113  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  35.61 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  34.64 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0383  IS1470, transposase  31.16 
 
 		 350 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0628  IS1470, transposase  31.16 
 
 		 350 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.19443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0712  IS1470, transposase  31.16 
 
 		 350 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0314  IS1470, transposase  30.14 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0967  IS1470, transposase  30.14 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.666025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1078  IS1470, transposase  30.14 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1373  IS1470, transposase  30.14 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.111224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2401  IS1470 transposase  30.14 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000104485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0648  IS1470, transposase  29.79 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  32.4 
 
 		 342 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0321  IS1470, transposase  29.79 
 
 		 350 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  31.02 
 
 		 408 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1131  IS30 family transposase  32.29 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3182  integrase catalytic subunit  33.11 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.815282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1469  integrase catalytic subunit  33.11 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1242  integrase catalytic subunit  33.11 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2173  integrase catalytic subunit  33.11 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0370565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1712  integrase catalytic subunit  33.11 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2716  integrase catalytic subunit  33.11 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000665461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0128  integrase catalytic subunit  33.11 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.763879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0141  integrase catalytic subunit  33.11 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000388252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0159  integrase catalytic subunit  33.11 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.988546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0496  integrase catalytic subunit  33.11 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  31.27 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  31.27 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  31.27 
 
 		 335 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  31.27 
 
 		 335 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  30.91 
 
 		 335 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 317 aa  115  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  31.86 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  32.06 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  31.2 
 
 		 370 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  35.21 
 
 		 399 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  35.21 
 
 		 399 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 401 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  30.31 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  31.27 
 
 		 385 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  30.6 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  29.77 
 
 		 386 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  32.96 
 
 		 386 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  32.96 
 
 		 386 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0358  IS1470, transposase  36.16 
 
 		 240 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0540717  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  32.42 
 
 		 457 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  32.42 
 
 		 457 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  32.42 
 
 		 457 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  30.8 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  28.72 
 
 		 340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  32.42 
 
 		 457 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  32.42 
 
 		 457 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  32.42 
 
 		 457 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  32.42 
 
 		 457 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  32.42 
 
 		 457 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  32.42 
 
 		 457 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  32.42 
 
 		 457 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  30.25 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  30.25 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  30.25 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  30.25 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  30.25 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  30.25 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  30.25 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  30.25 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  30.25 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>