More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0358 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0358  IS1470, transposase  100 
 
 
240 aa  487  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0540717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0314  IS1470, transposase  95.36 
 
 
350 aa  461  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0321  IS1470, transposase  95.36 
 
 
350 aa  461  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0648  IS1470, transposase  94.94 
 
 
350 aa  461  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0967  IS1470, transposase  95.36 
 
 
350 aa  461  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.666025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1078  IS1470, transposase  95.78 
 
 
350 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1373  IS1470, transposase  95.78 
 
 
350 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.111224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0379  IS1470, transposase  94.94 
 
 
350 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.728113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0383  IS1470, transposase  94.51 
 
 
350 aa  457  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0628  IS1470, transposase  94.94 
 
 
350 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.19443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0712  IS1470, transposase  94.94 
 
 
350 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2401  IS1470 transposase  94.94 
 
 
350 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000104485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1088  IS1470, transposase  94.51 
 
 
350 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.958304  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0659  IS1470, transposase  92.9 
 
 
268 aa  293  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2303  integrase catalytic subunit  54.51 
 
 
347 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000160202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0574  integrase catalytic subunit  54.51 
 
 
347 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000257634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1957  integrase catalytic subunit  54.51 
 
 
347 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2114  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2153  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0588  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0698  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2188  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1496  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1392  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0906223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1999  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2715  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000216698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3181  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1206  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0879  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0692  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0192  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0304  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0025223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0348  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000266386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0510  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3182  integrase catalytic subunit  43.95 
 
 
370 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.815282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1712  integrase catalytic subunit  43.95 
 
 
370 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2173  integrase catalytic subunit  43.95 
 
 
370 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0370565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2716  integrase catalytic subunit  43.95 
 
 
370 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000665461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1242  integrase catalytic subunit  43.95 
 
 
370 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1469  integrase catalytic subunit  43.95 
 
 
370 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0128  integrase catalytic subunit  43.95 
 
 
370 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.763879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0141  integrase catalytic subunit  43.95 
 
 
370 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000388252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0159  integrase catalytic subunit  43.95 
 
 
370 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.988546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0496  integrase catalytic subunit  43.95 
 
 
370 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0140  ISTde2, transposase  40.09 
 
 
358 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1022  ISTde2, transposase  40.09 
 
 
358 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0477791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1752  ISTde2, transposase  40.09 
 
 
358 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0660  IS1470, transposase  97.33 
 
 
75 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0555532  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1133  IS30 family transposase  38.65 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1130  IS30 family transposase  38.1 
 
 
305 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.679883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  34.63 
 
 
316 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  41.32 
 
 
386 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  36.2 
 
 
313 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  36.2 
 
 
313 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  36.2 
 
 
313 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  36.2 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  36.2 
 
 
313 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  36.2 
 
 
313 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  36.2 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  39.88 
 
 
386 aa  125  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  36.2 
 
 
313 aa  125  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  39.52 
 
 
386 aa  125  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  42.01 
 
 
313 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  39.88 
 
 
354 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  39.88 
 
 
383 aa  124  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  39.88 
 
 
383 aa  124  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  39.88 
 
 
383 aa  124  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  39.88 
 
 
383 aa  124  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  39.88 
 
 
383 aa  124  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  39.88 
 
 
383 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
313 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  39.88 
 
 
383 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2645  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
251 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4284  integrase catalytic subunit  35.79 
 
 
273 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  38.65 
 
 
457 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  38.65 
 
 
457 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  38.65 
 
 
457 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  37.36 
 
 
386 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>