More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1999 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0698  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2114  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1999  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2715  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000216698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1206  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0510  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0879  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3181  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1392  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0906223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2153  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1496  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2188  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  99.72 
 
 
356 aa  738    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0692  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0588  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0192  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0304  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0025223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0348  integrase catalytic subunit  100 
 
 
356 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000266386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0574  integrase catalytic subunit  69.88 
 
 
347 aa  511  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000257634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1957  integrase catalytic subunit  69.88 
 
 
347 aa  511  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2303  integrase catalytic subunit  69.88 
 
 
347 aa  511  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000160202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0383  IS1470, transposase  50.14 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0628  IS1470, transposase  50.14 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.19443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0712  IS1470, transposase  50.14 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0379  IS1470, transposase  50.14 
 
 
350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.728113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0314  IS1470, transposase  49.86 
 
 
350 aa  335  5e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0967  IS1470, transposase  49.86 
 
 
350 aa  335  5e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.666025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1078  IS1470, transposase  49.86 
 
 
350 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1373  IS1470, transposase  49.86 
 
 
350 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.111224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1088  IS1470, transposase  49.86 
 
 
350 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.958304  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0321  IS1470, transposase  49.57 
 
 
350 aa  333  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2401  IS1470 transposase  49.86 
 
 
350 aa  332  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000104485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0648  IS1470, transposase  49.57 
 
 
350 aa  332  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0358  IS1470, transposase  52.81 
 
 
240 aa  252  7e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0540717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1712  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2716  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000665461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1242  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1469  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2173  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0370565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3182  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.815282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0128  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.763879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0141  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000388252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0159  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.988546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0496  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0659  IS1470, transposase  45.35 
 
 
268 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0140  ISTde2, transposase  36.99 
 
 
358 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1022  ISTde2, transposase  36.99 
 
 
358 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0477791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1752  ISTde2, transposase  36.99 
 
 
358 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  34.02 
 
 
316 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  32.35 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1130  IS30 family transposase  34.04 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.679883  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1133  IS30 family transposase  34.04 
 
 
305 aa  161  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  33.93 
 
 
335 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  33.72 
 
 
335 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  33.93 
 
 
335 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  33.53 
 
 
383 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  34.02 
 
 
383 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  34.02 
 
 
383 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  34.02 
 
 
383 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  34.02 
 
 
383 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  34.02 
 
 
383 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  33.93 
 
 
335 aa  160  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  33.92 
 
 
383 aa  159  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  35.82 
 
 
315 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  35.52 
 
 
315 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  35.52 
 
 
315 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  35.52 
 
 
315 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  33.43 
 
 
335 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  31.86 
 
 
343 aa  157  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  33.53 
 
 
354 aa  155  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  32.25 
 
 
457 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  32.25 
 
 
457 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  32.25 
 
 
457 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  32.25 
 
 
457 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  32.25 
 
 
457 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  32.25 
 
 
457 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  32.25 
 
 
457 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  35.22 
 
 
315 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  32.25 
 
 
457 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  32.25 
 
 
457 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  32.25 
 
 
457 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  30.29 
 
 
339 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  33.73 
 
 
313 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  33.24 
 
 
423 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  33.73 
 
 
313 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  33.73 
 
 
313 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  33.73 
 
 
313 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  33.73 
 
 
313 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  33.24 
 
 
423 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  33.24 
 
 
423 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  33.24 
 
 
423 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  33.24 
 
 
423 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  33.73 
 
 
313 aa  150  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  33.63 
 
 
342 aa  149  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  32.65 
 
 
336 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
342 aa  149  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  32.74 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  31.4 
 
 
342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  33.14 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  33.43 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>