More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0141 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2716  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 370 aa  751    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000665461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3182  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 370 aa  751    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.815282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1712  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 370 aa  751    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2173  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 370 aa  751    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0370565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1469  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 370 aa  751    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1242  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 370 aa  751    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0128  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 370 aa  751    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.763879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0141  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 370 aa  751    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000388252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0159  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 370 aa  751    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.988546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0496  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 370 aa  751    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0140  ISTde2, transposase  54.08 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1022  ISTde2, transposase  54.08 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0477791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1752  ISTde2, transposase  54.08 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0574  integrase catalytic subunit  45.82 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000257634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2303  integrase catalytic subunit  45.82 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000160202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1957  integrase catalytic subunit  45.82 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  42.17 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1206  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0588  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0692  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1496  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1392  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0906223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3181  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0698  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0879  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1999  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2114  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2153  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2188  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2715  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000216698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0192  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0304  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0025223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0348  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000266386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0510  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0314  IS1470, transposase  41.41 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0967  IS1470, transposase  41.41 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.666025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1078  IS1470, transposase  41.41 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1373  IS1470, transposase  41.41 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.111224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0648  IS1470, transposase  41.24 
 
 		 350 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2401  IS1470 transposase  41.24 
 
 		 350 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000104485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1088  IS1470, transposase  41.41 
 
 		 350 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.958304  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0321  IS1470, transposase  41.13 
 
 		 350 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0379  IS1470, transposase  41.41 
 
 		 350 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.728113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0383  IS1470, transposase  41.41 
 
 		 350 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0628  IS1470, transposase  41.41 
 
 		 350 aa  239  8e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.19443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0712  IS1470, transposase  41.41 
 
 		 350 aa  239  8e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0358  IS1470, transposase  43.95 
 
 		 240 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0540717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0659  IS1470, transposase  39.42 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  33.53 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  33.53 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  33.53 
 
 		 313 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  33.73 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  33.23 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  33.23 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  33.23 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  33.23 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  33.23 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  28.69 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  28.69 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  28.69 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  28.69 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  28.69 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  28.69 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  28.69 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  28.69 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  28.69 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  31.64 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  31.64 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  31.64 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  32.24 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_62  putative integrase  32.14 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559018  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  29.89 
 
 		 339 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  29.89 
 
 		 339 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  29.89 
 
 		 339 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4602  Integrase catalytic region  29.67 
 
 		 333 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.792581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  31.34 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1131  IS30 family transposase  29.79 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5446  integrase catalytic region  28.66 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1130  IS30 family transposase  29.29 
 
 		 305 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.679883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  29.57 
 
 		 335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0454  transposase  28.82 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0164  transposase  28.82 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1466  transposase  28.82 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163454  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  28.82 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  28.82 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  28.82 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  28.82 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0259  transposase  28.82 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 343 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  29.57 
 
 		 335 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  29.57 
 
 		 335 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3555  Integrase catalytic region  30.56 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1133  IS30 family transposase  29.29 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  29.57 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1287  integrase catalytic region  27.46 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4885  integrase catalytic region  27.46 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6420  integrase catalytic region  27.46 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  29.28 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  29.07 
 
 		 317 aa  126  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0968  transposase  30.29 
 
 		 330 aa  126  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>