More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0786 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1044  integrase catalytic subunit  99.69 
 
 		 322 aa  678    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.343683  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0153  integrase catalytic subunit  97.83 
 
 		 322 aa  665    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0786  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 322 aa  678    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1724  integrase catalytic subunit  97.83 
 
 		 322 aa  665    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1916  integrase catalytic subunit  96.89 
 
 		 322 aa  657    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1357  IS30 family transposase  99.05 
 
 		 210 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1002  integrase catalytic subunit  87.61 
 
 		 218 aa  403  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1584  integrase catalytic subunit  78.67 
 
 		 211 aa  354  1e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00305908  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1003  hypothetical protein  81.61 
 
 		 87 aa  153  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  32.91 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  32.07 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  32.07 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  32.07 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  31.41 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  31.41 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0164  transposase  31.41 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  31.41 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0259  transposase  31.41 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0454  transposase  31.41 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  31.41 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1466  transposase  31.41 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163454  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  31.48 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  31.48 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  31.17 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  31.17 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  31.17 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0574  integrase catalytic subunit  29.13 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000257634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1957  integrase catalytic subunit  29.13 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2303  integrase catalytic subunit  29.13 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000160202  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1090  transposase  32.1 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1130  IS30 family transposase  30.74 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.679883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  29.24 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  28.53 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  29.56 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  30.82 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  30.82 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  30.82 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  30.82 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_62  putative integrase  32.24 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559018  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1133  IS30 family transposase  30.74 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  30.82 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  26.36 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  30.82 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  30.82 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1078  IS1470, transposase  28.96 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1373  IS1470, transposase  28.96 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.111224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0314  IS1470, transposase  28.96 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0648  IS1470, transposase  28.66 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0967  IS1470, transposase  28.96 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.666025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2401  IS1470 transposase  28.66 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000104485  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4598  integrase catalytic region  31.38 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658664  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  29.25 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0628  IS1470, transposase  28.66 
 
 		 350 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.19443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0712  IS1470, transposase  28.66 
 
 		 350 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0321  IS1470, transposase  28.66 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0879  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3181  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0698  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2153  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1999  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1392  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0906223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2114  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0379  IS1470, transposase  28.66 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.728113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0588  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0692  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2188  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2715  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000216698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0510  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1206  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1496  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0192  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0304  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0025223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0348  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000266386  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7566  transposase  33.76 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  35.53 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0383  IS1470, transposase  28.53 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  35.53 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0141  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5446  integrase catalytic region  28.62 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  27.83 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0356  IS30 family transposase  30.06 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  28.93 
 
 		 315 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1088  IS1470, transposase  28.53 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.958304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  28.93 
 
 		 315 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>