More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0659 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0659  IS1470, transposase  100 
 
 		 268 aa  551  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0314  IS1470, transposase  99.25 
 
 		 350 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0321  IS1470, transposase  98.88 
 
 		 350 aa  543  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0967  IS1470, transposase  99.25 
 
 		 350 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.666025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1078  IS1470, transposase  98.88 
 
 		 350 aa  543  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1373  IS1470, transposase  98.88 
 
 		 350 aa  543  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.111224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2401  IS1470 transposase  99.25 
 
 		 350 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000104485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0648  IS1470, transposase  98.51 
 
 		 350 aa  542  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0379  IS1470, transposase  96.64 
 
 		 350 aa  530  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.728113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0383  IS1470, transposase  97.01 
 
 		 350 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0628  IS1470, transposase  97.01 
 
 		 350 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.19443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0712  IS1470, transposase  97.01 
 
 		 350 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1088  IS1470, transposase  96.64 
 
 		 350 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.958304  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1578  IS1470, transposase  99.32 
 
 		 154 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000377469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0358  IS1470, transposase  92.9 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0540717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2303  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000160202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0574  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000257634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1957  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1496  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1999  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1392  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0906223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2153  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2114  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2715  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000216698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3181  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2188  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1206  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0879  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0192  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0304  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0025223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0348  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000266386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0510  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0588  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0692  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0698  integrase catalytic subunit  45.35 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1712  integrase catalytic subunit  39.42 
 
 		 370 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2173  integrase catalytic subunit  39.42 
 
 		 370 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0370565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2716  integrase catalytic subunit  39.42 
 
 		 370 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000665461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3182  integrase catalytic subunit  39.42 
 
 		 370 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.815282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1242  integrase catalytic subunit  39.42 
 
 		 370 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1469  integrase catalytic subunit  39.42 
 
 		 370 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0128  integrase catalytic subunit  39.42 
 
 		 370 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.763879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0141  integrase catalytic subunit  39.42 
 
 		 370 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000388252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0159  integrase catalytic subunit  39.42 
 
 		 370 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.988546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0496  integrase catalytic subunit  39.42 
 
 		 370 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0140  ISTde2, transposase  32.27 
 
 		 358 aa  129  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1022  ISTde2, transposase  32.27 
 
 		 358 aa  129  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0477791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1752  ISTde2, transposase  32.27 
 
 		 358 aa  129  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1131  IS30 family transposase  29.02 
 
 		 341 aa  91.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  29.73 
 
 		 316 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_62  putative integrase  30.2 
 
 		 321 aa  87.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559018  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0356  IS30 family transposase  29.48 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  30.5 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  30.5 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  30.5 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  30.5 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  30.5 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0245  integrase catalytic subunit  27.71 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00234461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  27.76 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  31.4 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1130  IS30 family transposase  30.04 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.679883  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  28.46 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1133  IS30 family transposase  30.04 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  31.01 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  31.01 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  28.4 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0307  IS30 family transposase  29.08 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1811  IS30 family transposase  28.69 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  29.96 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  29.96 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  28.41 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3408  putative transposase IS30  28.36 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  29.96 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  29.96 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  29.96 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  28.41 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  28.41 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  28.41 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  28.41 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  28.41 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  28.41 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03536  IS30 transposase  28.03 
 
 		 374 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.727826  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03481  hypothetical protein  28.03 
 
 		 374 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4284  integrase catalytic subunit  31.55 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  26.89 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  25.57 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  29.66 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  29.28 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  29.28 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  29.28 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>