55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1578 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1578  IS1470, transposase  100 
 
 		 154 aa  319  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000377469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2401  IS1470 transposase  100 
 
 		 350 aa  307  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000104485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0659  IS1470, transposase  99.32 
 
 		 268 aa  306  6.999999999999999e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1373  IS1470, transposase  98.65 
 
 		 350 aa  304  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.111224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1078  IS1470, transposase  98.65 
 
 		 350 aa  304  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0967  IS1470, transposase  98.65 
 
 		 350 aa  304  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.666025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0314  IS1470, transposase  98.65 
 
 		 350 aa  304  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0321  IS1470, transposase  98.65 
 
 		 350 aa  304  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0648  IS1470, transposase  98.65 
 
 		 350 aa  304  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0712  IS1470, transposase  97.3 
 
 		 350 aa  301  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0383  IS1470, transposase  97.3 
 
 		 350 aa  301  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0628  IS1470, transposase  97.3 
 
 		 350 aa  301  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.19443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0379  IS1470, transposase  96.62 
 
 		 350 aa  299  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.728113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1088  IS1470, transposase  96.62 
 
 		 350 aa  298  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.958304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0304  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0025223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0510  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1999  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0348  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000266386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1496  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0588  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0692  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0698  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0879  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1206  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1392  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0906223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0192  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2114  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2153  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3181  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2188  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2715  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000216698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 		 356 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0574  integrase catalytic subunit  42.95 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000257634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1957  integrase catalytic subunit  42.95 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2303  integrase catalytic subunit  42.95 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000160202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2173  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 		 370 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0370565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1712  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 		 370 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2716  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 		 370 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000665461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1469  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 		 370 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1242  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 		 370 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0496  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 		 370 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0159  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 		 370 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.988546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0141  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 		 370 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000388252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0128  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 		 370 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.763879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3182  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 		 370 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.815282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0358  IS1470, transposase  91.43 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0540717  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1022  ISTde2, transposase  29.68 
 
 		 358 aa  63.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0477791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1752  ISTde2, transposase  29.68 
 
 		 358 aa  63.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0140  ISTde2, transposase  29.68 
 
 		 358 aa  63.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1774  IS30 family transposase  23.53 
 
 		 197 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  25.98 
 
 		 343 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  26.36 
 
 		 339 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  26.36 
 
 		 339 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  26.36 
 
 		 339 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_62  putative integrase  25.4 
 
 		 321 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>