35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1248 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  49.3 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  32.21 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  28.31 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  32.97 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2169  hypothetical protein  30.14 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  25.73 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  25.68 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1325  hypothetical protein  32.08 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00182706  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0874  hypothetical protein  28.42 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0432  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000142024  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1270  protein of unknown function DUF1275  24.54 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  27.42 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  24.84 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  24.84 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  25.74 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  24.38 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  24.18 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  24.18 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  24.18 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  24.18 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  24.18 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  24.14 
 
 		 273 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  27.66 
 
 		 248 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  26.43 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  23.15 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0548  protein of unknown function DUF1275  25.26 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  25.12 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  23.88 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1559  hypothetical protein  25.71 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2000  hypothetical protein  20.95 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  24.17 
 
 		 262 aa  45.1  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  34.21 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5622  protein of unknown function DUF1275  32.63 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.37363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>