36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0942 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  100 
 
 		 238 aa  483  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  99.46 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  47.02 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  47.02 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  39.89 
 
 		 202 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  41.27 
 
 		 197 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  45.06 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  38.86 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  40.34 
 
 		 181 aa  149  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  42.26 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  42.11 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  42.11 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  41.57 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  39.78 
 
 		 198 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  41.04 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  40.46 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  40.85 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  39.55 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  37.57 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  37.89 
 
 		 204 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  24.84 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  27.37 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  23.16 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  27.37 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  24 
 
 		 187 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  27.37 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.49 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  22.3 
 
 		 180 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2066  fatty acyl-CoA synthetase  21.74 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  21.21 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1763  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.11 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  24.49 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.3 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  21.13 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3596  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.67 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.74 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>