More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3677 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3677  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04552  transcriptional regulator  65.74 
 
 		 260 aa  342  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.552506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0718  protein of unknown function DUF344  63.75 
 
 		 260 aa  310  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15403  normal  0.613775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  55.56 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  50.19 
 
 		 288 aa  271  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  53.85 
 
 		 280 aa  268  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  52.28 
 
 		 324 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  53.07 
 
 		 310 aa  265  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  50.85 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  55.2 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4193  hypothetical protein  48.47 
 
 		 278 aa  262  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  51.93 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  53.28 
 
 		 304 aa  261  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  53.28 
 
 		 304 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  47.66 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4075  hypothetical protein  51.04 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  53.51 
 
 		 305 aa  259  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  49.21 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  53.3 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  53.3 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  48.57 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  49.4 
 
 		 304 aa  258  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  51.85 
 
 		 305 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  51.69 
 
 		 314 aa  258  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5508  hypothetical protein  49.18 
 
 		 283 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.980211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  52.52 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  51.64 
 
 		 357 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  53.25 
 
 		 338 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  51.03 
 
 		 314 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  51.64 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  51.71 
 
 		 331 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  54.09 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  51.03 
 
 		 316 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1377  hypothetical protein  47.49 
 
 		 274 aa  255  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  52.16 
 
 		 297 aa  255  5e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  51.72 
 
 		 302 aa  255  5e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  51.03 
 
 		 316 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  51.03 
 
 		 316 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  51.03 
 
 		 316 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  47.1 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  51.26 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  51.53 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  52.12 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2307  hypothetical protein  53.07 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.127828 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  52.61 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  51.21 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  49.39 
 
 		 305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  49.59 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  50.62 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  50.65 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  51.77 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  53.42 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  50.21 
 
 		 326 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  50.9 
 
 		 258 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  52.17 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  49.36 
 
 		 306 aa  251  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  53.85 
 
 		 258 aa  251  8.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  50 
 
 		 310 aa  250  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  46.39 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  55.2 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  53.39 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  52.97 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  48.16 
 
 		 263 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5312  protein of unknown function DUF344  51.6 
 
 		 286 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0163958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1700  protein of unknown function DUF344  51.6 
 
 		 286 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  50.88 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  53.64 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  53.64 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  53.64 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  52.89 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  48.4 
 
 		 304 aa  248  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  52.21 
 
 		 306 aa  248  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  55.02 
 
 		 513 aa  248  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  53.18 
 
 		 308 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  53.85 
 
 		 327 aa  248  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  53.64 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  52.73 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  51.44 
 
 		 338 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  50.64 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  53.64 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  47.04 
 
 		 276 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  47.7 
 
 		 308 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  50.64 
 
 		 274 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2051  hypothetical protein  47.19 
 
 		 273 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  51.3 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  47.7 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  53.7 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  50 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  53.39 
 
 		 375 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3502  hypothetical protein  48.35 
 
 		 273 aa  245  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  53.24 
 
 		 300 aa  244  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  46.69 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  52.04 
 
 		 391 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  52.49 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  53.21 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  49.4 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  50.42 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  47.97 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  52.12 
 
 		 340 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  45.69 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>