More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3638 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3638  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  664    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4444  oxidoreductase domain-containing protein  88.64 
 
 		 319 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122065  normal  0.178322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0329  oxidoreductase-like  87.74 
 
 		 318 aa  590  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5184  oxidoreductase domain protein  85.76 
 
 		 319 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  84.28 
 
 		 320 aa  571  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2703  4-carboxy-2-hydroxymuconate-6-semialdehyde dehydrogenase  85.44 
 
 		 319 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0871  oxidoreductase-like  84.49 
 
 		 319 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.635047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0981  oxidoreductase-like  82.91 
 
 		 319 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0171  oxidoreductase domain-containing protein  80.7 
 
 		 317 aa  537  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3884  oxidoreductase-like  75.72 
 
 		 312 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  76.28 
 
 		 314 aa  501  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4372  oxidoreductase domain-containing protein  70.03 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3923  oxidoreductase domain-containing protein  66.35 
 
 		 315 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3203  oxidoreductase domain-containing protein  56.78 
 
 		 315 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0286  oxidoreductase-like protein  42.27 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.05 
 
 		 353 aa  95.9  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  27.83 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  29.24 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.52 
 
 		 356 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  28.46 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  33.33 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  34.23 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 387 aa  82.4  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  34.75 
 
 		 374 aa  82.4  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  30.7 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  27.27 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  28.23 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  24.68 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  30.73 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  26.2 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  28.14 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  25.08 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  24.71 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  30.26 
 
 		 346 aa  79  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.22 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.59 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  31.48 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  28.27 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  39.17 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.9 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  26.2 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  26.09 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  24.89 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  31.14 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  27.55 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  34.62 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  32.88 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  32.88 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.7 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  32.12 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  32.88 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  24.21 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.7 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  32.88 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  32.88 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  26.64 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  21.89 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  29.03 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  32.37 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  32.14 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  35.46 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 371 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>