284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0893 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0893  Glycerone kinase  100 
 
 		 546 aa  1059    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2726  Glycerone kinase  63.75 
 
 		 556 aa  631  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2889  Glycerone kinase  54.56 
 
 		 542 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4584  Glycerone kinase  48.51 
 
 		 539 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2432  Glycerone kinase  53.28 
 
 		 547 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3653  dihydroxyacetone kinase  52.65 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2167  Glycerone kinase  52.94 
 
 		 544 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0963  Glycerone kinase  54.31 
 
 		 545 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1031  Glycerone kinase  54.53 
 
 		 545 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593318  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1158  Glycerone kinase  55.45 
 
 		 545 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3559  Glycerone kinase  52.31 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.463491  normal  0.192785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2326  Glycerone kinase  46.56 
 
 		 562 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  39.73 
 
 		 580 aa  326  6e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42962  2-phosphoglycerate dehydratase  36.32 
 
 		 577 aa  293  5e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  43.6 
 
 		 567 aa  286  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  43.49 
 
 		 567 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  39.97 
 
 		 567 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04180  dihydroxyacetone kinase 1, putative  34.56 
 
 		 591 aa  253  5.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.12537  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  38.86 
 
 		 570 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  38.79 
 
 		 570 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  38.32 
 
 		 616 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  38.47 
 
 		 570 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  38.14 
 
 		 616 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  37.24 
 
 		 572 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  38.11 
 
 		 566 aa  241  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  37.52 
 
 		 566 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  33.56 
 
 		 583 aa  239  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  36.7 
 
 		 546 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  37.02 
 
 		 569 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  37.02 
 
 		 569 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  32.99 
 
 		 583 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  32.37 
 
 		 583 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  32.37 
 
 		 583 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57462  dihydroxyacetone kinase  32.49 
 
 		 595 aa  233  8.000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0972297  normal  0.404993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  32.99 
 
 		 583 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  32.54 
 
 		 583 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  32.82 
 
 		 583 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  33.22 
 
 		 583 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00034  dihydroxyacetone kinase (Eurofung)  33.7 
 
 		 590 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.160552 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  33.05 
 
 		 583 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  33.22 
 
 		 583 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.13 
 
 		 329 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31117  dihydroxyacetone kinase isoenzyme I  31.94 
 
 		 597 aa  227  4e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  32.37 
 
 		 583 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  31.12 
 
 		 582 aa  223  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08050  glycerone kinase, putative  33.55 
 
 		 600 aa  220  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.71 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.62 
 
 		 322 aa  214  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.62 
 
 		 322 aa  214  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.75 
 
 		 320 aa  212  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4000  Glycerone kinase  37.64 
 
 		 560 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  33.93 
 
 		 544 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.36 
 
 		 332 aa  205  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.68 
 
 		 332 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.31 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.04 
 
 		 332 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.51 
 
 		 332 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.14 
 
 		 329 aa  197  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  36.84 
 
 		 573 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  34.94 
 
 		 544 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1105  Glycerone kinase  34.53 
 
 		 572 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.99 
 
 		 333 aa  194  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  34.58 
 
 		 544 aa  193  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  34.58 
 
 		 544 aa  193  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.08 
 
 		 333 aa  193  9e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.76 
 
 		 333 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  35.03 
 
 		 325 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.25 
 
 		 333 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  34.69 
 
 		 616 aa  191  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.71 
 
 		 332 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  30.94 
 
 		 598 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.08 
 
 		 333 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  41.51 
 
 		 332 aa  187  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.99 
 
 		 333 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53027  Dihydroxyacetone kinase 1 (Glycerone kinase 1) (DHA kinase 1)  28.14 
 
 		 595 aa  181  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  34.16 
 
 		 331 aa  180  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.23 
 
 		 364 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.35 
 
 		 330 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  36.64 
 
 		 352 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.11 
 
 		 354 aa  178  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  35.32 
 
 		 581 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  35.32 
 
 		 581 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.08 
 
 		 331 aa  176  7e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.81 
 
 		 332 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  35.13 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  32.88 
 
 		 581 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  39.31 
 
 		 327 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  36.54 
 
 		 333 aa  174  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.73 
 
 		 333 aa  173  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  33.62 
 
 		 587 aa  172  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3102  dihydroxyacetone kinase  34.24 
 
 		 568 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.19 
 
 		 330 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  31.77 
 
 		 589 aa  170  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  34.51 
 
 		 354 aa  170  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.91 
 
 		 354 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  34.26 
 
 		 369 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  34.32 
 
 		 354 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  34.38 
 
 		 356 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  34.66 
 
 		 356 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  34.94 
 
 		 356 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0517776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>