More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1509 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1509  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
271 aa  560  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  38.89 
 
 
286 aa  206  5e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  35.29 
 
 
271 aa  169  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  37.09 
 
 
273 aa  168  7e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  34.43 
 
 
269 aa  160  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  37.04 
 
 
268 aa  159  6e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  34.55 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  32.84 
 
 
269 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  32.84 
 
 
269 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  32.47 
 
 
269 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  33.82 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  33.46 
 
 
279 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  33.58 
 
 
281 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  34.18 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  31.64 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  33.21 
 
 
281 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  33.45 
 
 
270 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  33.45 
 
 
270 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  33.45 
 
 
270 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  33.45 
 
 
270 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  33.45 
 
 
270 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  33.45 
 
 
270 aa  143  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  33.21 
 
 
281 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  32.85 
 
 
270 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  33.45 
 
 
270 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  33.45 
 
 
270 aa  142  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  32.85 
 
 
270 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  32.34 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  31.6 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  33.45 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  32.48 
 
 
270 aa  138  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  34.89 
 
 
269 aa  136  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  31.5 
 
 
273 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  29.04 
 
 
277 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  32.62 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  33.93 
 
 
274 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  34.05 
 
 
273 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  31.62 
 
 
267 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  29.52 
 
 
281 aa  122  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  31.25 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  32.74 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  30 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  33.94 
 
 
265 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  30.18 
 
 
270 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  30 
 
 
277 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  29.78 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  29.89 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  30.51 
 
 
273 aa  116  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1176  HAD superfamily hydrolase  30.51 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.534777  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  32.73 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  29.2 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2000  HAD superfamily hydrolase  29.41 
 
 
273 aa  109  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1405  Cof-like hydrolase  26.39 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  30.69 
 
 
279 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  29.37 
 
 
268 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  30.32 
 
 
274 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  31.64 
 
 
267 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  31.64 
 
 
267 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  30.74 
 
 
265 aa  106  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  30.42 
 
 
272 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  30.07 
 
 
279 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  28.87 
 
 
276 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  29.06 
 
 
266 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  27.08 
 
 
270 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  30.74 
 
 
273 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
279 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  31.47 
 
 
275 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  28.17 
 
 
276 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  29.93 
 
 
269 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  28.91 
 
 
292 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  28.25 
 
 
268 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  29.25 
 
 
289 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  29.25 
 
 
289 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  29.51 
 
 
275 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  29.75 
 
 
273 aa  99.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  29.97 
 
 
274 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  29.77 
 
 
286 aa  98.6  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  29.08 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  28.94 
 
 
277 aa  96.3  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  27.8 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  27.74 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  30.85 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.88 
 
 
273 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.18 
 
 
273 aa  92  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  27.37 
 
 
271 aa  92  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0762  Cof-like hydrolase  25.91 
 
 
277 aa  92  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.82 
 
 
273 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0823  HAD superfamily hydrolase  27.11 
 
 
279 aa  91.3  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  28.42 
 
 
273 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  29.82 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  29.82 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  29.82 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  29.85 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.82 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  29.82 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  28.42 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  29.47 
 
 
273 aa  90.1  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3223  Cof-like hydrolase  29.27 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  27.53 
 
 
273 aa  89  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  28.07 
 
 
273 aa  89  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>