More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0362 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 120 aa  223  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  68.07 
 
 		 119 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  66.12 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0568  50S ribosomal protein L7/L12  67.21 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166247  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  62.3 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1416  50S ribosomal protein L12P  68.6 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000264913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3690  50S ribosomal protein L7/L12  65.83 
 
 		 120 aa  120  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  57.5 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0314  50S ribosomal protein L7/L12  70.25 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000853139  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0272  50S ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.079724  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 		 123 aa  117  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  64.17 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  63.93 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1301  50S ribosomal protein L7/L12  66.12 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0017753  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  64.17 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  65 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  64.17 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  63.87 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  63.93 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  51.16 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  64.41 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  64.46 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  62.81 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  62.81 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  62.3 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  51.24 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 125 aa  110  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 		 123 aa  107  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  48.76 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  54.69 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0041  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0709556  hitchhiker  0.00000000000056539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  47.11 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  56.45 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  51.24 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  47.54 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  47.54 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2263  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  52 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  47.54 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  57.72 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  57.14 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  56.91 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3641  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.180921 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2107  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000324258  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2197  50S ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000379347  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  52 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 121 aa  100  9e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  51.59 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3593  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 		 123 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100169  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  53.28 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  60.34 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  45.45 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4443  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>