44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1136 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1136  permease, cadmium resistance protein  100 
 
 		 204 aa  394  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000632381  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  35.12 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  35.12 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  34.15 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  33.66 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  36.1 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  29.56 
 
 		 212 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  28.3 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  28.44 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  30.54 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  35.61 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  27.01 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  28.57 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  29.75 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  36.7 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  36.7 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  36.7 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1820  permease cadmium resistance protein-like protein  23.83 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135691  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  28.42 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  28.21 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  27.4 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  28.92 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  28.93 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  26.51 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2208  permease, cadmium resistance protein  34.34 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  27.23 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  27.23 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  24.04 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  25.25 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  28.43 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  30 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  23.44 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  27.86 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  27.64 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  30 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  25.76 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  25.37 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1729  hypothetical protein  24.37 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  24.64 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  27.27 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  22.34 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  25.74 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  29.93 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  25 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>