More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0952 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  100 
 
 
280 aa  538  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  56.83 
 
 
288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  56.47 
 
 
288 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  56.83 
 
 
288 aa  301  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  56.83 
 
 
288 aa  301  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  54.93 
 
 
288 aa  300  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  56.36 
 
 
279 aa  299  3e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  55.47 
 
 
277 aa  295  8e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  52.29 
 
 
278 aa  271  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  52.29 
 
 
278 aa  271  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  53.45 
 
 
289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  53.78 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  47.41 
 
 
300 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  49.82 
 
 
312 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  44.96 
 
 
281 aa  239  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  45.95 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  45.69 
 
 
304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  47.39 
 
 
294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  45.66 
 
 
291 aa  231  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  44.24 
 
 
291 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  44.36 
 
 
285 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  47.65 
 
 
290 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  45.13 
 
 
278 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  45.13 
 
 
278 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  44.6 
 
 
290 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  47.84 
 
 
290 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  39.86 
 
 
285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  48.3 
 
 
306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  44.6 
 
 
290 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  46.95 
 
 
280 aa  221  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  45.62 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  47.97 
 
 
289 aa  218  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  40.3 
 
 
277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  46.59 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  41.79 
 
 
282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  44.06 
 
 
304 aa  211  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  41.18 
 
 
297 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  41.18 
 
 
297 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  41.18 
 
 
297 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  40.3 
 
 
285 aa  209  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  45.85 
 
 
290 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  46.4 
 
 
291 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  44.78 
 
 
289 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  46.1 
 
 
303 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  38.57 
 
 
287 aa  206  4e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  40.61 
 
 
287 aa  205  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  42.96 
 
 
276 aa  205  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  44.79 
 
 
281 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  41 
 
 
287 aa  205  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  40.67 
 
 
286 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  38.08 
 
 
287 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  40.29 
 
 
285 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  40 
 
 
283 aa  201  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  40.38 
 
 
285 aa  201  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  42.06 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  41.15 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  41.22 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  41.3 
 
 
290 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  41.3 
 
 
290 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  38.2 
 
 
285 aa  198  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  42.35 
 
 
279 aa  198  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  37.08 
 
 
285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  43.59 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  40.23 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  39.7 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  39.48 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  40.6 
 
 
294 aa  195  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  40.6 
 
 
294 aa  195  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  37.08 
 
 
286 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  37.08 
 
 
286 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  37.08 
 
 
286 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  37.08 
 
 
286 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  40 
 
 
275 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  41.63 
 
 
282 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  37.78 
 
 
285 aa  193  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  40.23 
 
 
294 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  36.7 
 
 
286 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  41.25 
 
 
282 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  41.25 
 
 
282 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  41.25 
 
 
282 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  37.84 
 
 
291 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  41.07 
 
 
296 aa  190  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  39.78 
 
 
285 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  37.74 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  40.86 
 
 
282 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  37.41 
 
 
285 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  42.41 
 
 
278 aa  189  5e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  36.3 
 
 
285 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  37.45 
 
 
286 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  42.06 
 
 
287 aa  186  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3369  ABC-3 protein  42.18 
 
 
289 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  40 
 
 
285 aa  185  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  38.81 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  41.28 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  37.02 
 
 
286 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  38.32 
 
 
286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  40.32 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  38.32 
 
 
286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  42.7 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  37.8 
 
 
279 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>