More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0780 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  100 
 
 
303 aa  618  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  67.11 
 
 
305 aa  428  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  60.2 
 
 
302 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  59.74 
 
 
301 aa  381  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  60.4 
 
 
301 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  60.07 
 
 
301 aa  378  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  60.86 
 
 
302 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  60.67 
 
 
299 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  63.37 
 
 
301 aa  378  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  59.41 
 
 
301 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  59.41 
 
 
301 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  59.67 
 
 
299 aa  374  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  59.08 
 
 
301 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  59.41 
 
 
301 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  59.41 
 
 
301 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  59.08 
 
 
301 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  59.41 
 
 
301 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  59.74 
 
 
301 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  58.22 
 
 
303 aa  375  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  55.37 
 
 
299 aa  354  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  55.37 
 
 
299 aa  354  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  56.23 
 
 
303 aa  345  6e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  53.36 
 
 
299 aa  338  8e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  52.49 
 
 
302 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  52.56 
 
 
303 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  50 
 
 
300 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  51.18 
 
 
297 aa  305  7e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  49.66 
 
 
293 aa  305  8.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  47.02 
 
 
300 aa  301  7.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  51.84 
 
 
337 aa  299  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  49 
 
 
305 aa  299  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  49.49 
 
 
308 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  50.84 
 
 
311 aa  298  5e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  50.67 
 
 
299 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 
298 aa  296  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  49.33 
 
 
298 aa  293  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  51.17 
 
 
298 aa  292  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  48.99 
 
 
301 aa  289  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  47.83 
 
 
297 aa  288  9e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  48.66 
 
 
297 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  47.99 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  46.64 
 
 
303 aa  281  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  48.49 
 
 
296 aa  281  8.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  47.83 
 
 
296 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  48.32 
 
 
314 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  48.32 
 
 
314 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  47.67 
 
 
310 aa  278  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  49.16 
 
 
318 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  44.07 
 
 
294 aa  277  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  44.75 
 
 
296 aa  275  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  52 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  47.44 
 
 
302 aa  271  7e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  49.66 
 
 
315 aa  271  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  46.44 
 
 
303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  48.31 
 
 
300 aa  269  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  46.2 
 
 
307 aa  268  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 
306 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  47.46 
 
 
301 aa  265  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  44.63 
 
 
313 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  46.13 
 
 
299 aa  264  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 
315 aa  263  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  44.63 
 
 
313 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 
319 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  46.1 
 
 
293 aa  261  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  45.96 
 
 
301 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  45.58 
 
 
301 aa  258  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  45.96 
 
 
300 aa  256  5e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 
303 aa  255  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  45.33 
 
 
311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  43 
 
 
322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
303 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  45.07 
 
 
303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 
303 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  43.62 
 
 
301 aa  251  1e-65  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  44.95 
 
 
303 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 
310 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  44.12 
 
 
310 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 
312 aa  248  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  43.43 
 
 
324 aa  247  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  43.14 
 
 
314 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  42.77 
 
 
343 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  41.53 
 
 
303 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  44.12 
 
 
310 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  46.33 
 
 
449 aa  245  9e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0507  GTP-binding protein Era  43.38 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000333853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  40.47 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  42.37 
 
 
301 aa  243  3e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  46.36 
 
 
451 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  45.36 
 
 
303 aa  241  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  40.53 
 
 
300 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  42.38 
 
 
314 aa  239  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0864  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
296 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1008  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
296 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 
296 aa  238  8e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  44.59 
 
 
306 aa  238  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 
310 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 
307 aa  237  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  41.47 
 
 
310 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 
308 aa  236  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>