59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0475 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  100 
 
 
383 aa  784    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  51.79 
 
 
381 aa  368  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  27.09 
 
 
371 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  31.07 
 
 
396 aa  142  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  26.69 
 
 
371 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  27.86 
 
 
351 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  27.14 
 
 
351 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  27.24 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  27.59 
 
 
352 aa  94  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  24.91 
 
 
360 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  27.49 
 
 
302 aa  90.1  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  27.18 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  26.37 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  26.37 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  26.09 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  27.35 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  25.99 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.44 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  25.67 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  25.27 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  25 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.33 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.49 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.82 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  24.92 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  23.95 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.45 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  24.17 
 
 
353 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  25.77 
 
 
364 aa  62.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  25.18 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  23.23 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.61 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  25.18 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  24.02 
 
 
341 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  23.76 
 
 
367 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  20.98 
 
 
360 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  24.39 
 
 
348 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  27.08 
 
 
332 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  24.81 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  23.66 
 
 
327 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  28.77 
 
 
414 aa  57  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  24.15 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  25 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.42 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  23.08 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.34 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.47 
 
 
364 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  23.72 
 
 
340 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.57 
 
 
414 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.7 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  27.48 
 
 
368 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  28.78 
 
 
365 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  27.48 
 
 
368 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  26.72 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.87 
 
 
372 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3430  AAA family ATPase  30.08 
 
 
867 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  20.98 
 
 
505 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3559  type VI secretion ATPase  30.08 
 
 
862 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  23.94 
 
 
334 aa  43.1  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>