67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0360 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0360  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  100 
 
 
406 aa  816    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1945  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  38.82 
 
 
453 aa  256  5e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.645504  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1533  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  30.51 
 
 
414 aa  144  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1451  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  25.82 
 
 
409 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0635  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  26.51 
 
 
412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000153887  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0228  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  21.59 
 
 
393 aa  113  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1730  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  23.4 
 
 
411 aa  109  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000352957  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4513  hypothetical protein  26.98 
 
 
432 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.2961  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2365  hypothetical protein  24.3 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2410  hypothetical protein  24.3 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0745502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4022  ABC transporter, permease component, putative sodium exporter  24.11 
 
 
413 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0731  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  22.25 
 
 
390 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3209  sodium export permease protein  24.82 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1946  ABC-2 type transporter  24.1 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4621  hypothetical protein  28.62 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4744  hypothetical protein  28.28 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4256  hypothetical protein  28.62 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4404  hypothetical protein  28.28 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.09 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0945  ABC transporter, permease protein, putative  20.58 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0199205 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08266  ABC transporter, permease protein, putative  22.62 
 
 
433 aa  77.8  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30220  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  27.02 
 
 
407 aa  77  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.861624  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6163  ABC transporter permease  27.55 
 
 
371 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19888  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  26.71 
 
 
403 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  26.71 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1273  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  22.19 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1116  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  27.57 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0532  ABC-type Na+ efflux pump permease component  23.17 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4635  hypothetical protein  24.14 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1059  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.85 
 
 
457 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.163235  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2039  ABC-2 type transporter  22.77 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5048  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  22.62 
 
 
438 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.626469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5257  hypothetical protein  25.87 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0108  putative ABC transporter  20.19 
 
 
438 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850247  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0486  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.7 
 
 
419 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0852  sodium extrusion protein NatB, putative  22.36 
 
 
416 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2673  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.05 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270062  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4966  ABC transporter, permease protein, putative  19.91 
 
 
439 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1384  putative ABC transporter permease  27.52 
 
 
405 aa  63.2  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.378059  normal  0.872307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0582  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  29.53 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_756  ABC transporter, permease protein  20.39 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0135656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2404  hypothetical protein  20.05 
 
 
429 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.398451  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1452  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.27 
 
 
411 aa  60.1  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.75331  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0771  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  20.91 
 
 
405 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1794  hypothetical protein  26.83 
 
 
353 aa  60.1  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37432  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2743  ABC-type Na+ efflux pump permease component  21.88 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306664  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7296  hypothetical protein  21.64 
 
 
437 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1780  hypothetical protein  27.44 
 
 
353 aa  57  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1740  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  20.97 
 
 
441 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0905  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  21.81 
 
 
366 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.17496  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0859  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  21.26 
 
 
368 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00918968  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4244  hypothetical protein  23.51 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4637  sodium export permease protein  23.51 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  23.73 
 
 
466 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  21.99 
 
 
411 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0219  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  21.49 
 
 
414 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4337  ABC-2 type transport system permease protein  23.02 
 
 
407 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2712  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  24.86 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0618  sodium export permease protein  21.04 
 
 
408 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4617  sodium export permease protein  20.71 
 
 
408 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2601  putative ABC transporter permease  24.12 
 
 
412 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3030  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  25.11 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.509957  hitchhiker  0.000114076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4173  putative ABC transporter  26.94 
 
 
390 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0836  ABC transporter permease  25.41 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26820  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  20.93 
 
 
379 aa  47  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749324  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2425  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.19 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1046  hypothetical protein  21.61 
 
 
429 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.75067  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>