59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1400 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1400  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1597  CBS domain-containing protein  37.01 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0305  CBS domain-containing protein  38.56 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0544  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.761557  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1825  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897459 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0789  putative transcriptional regulator, XRE family  30.52 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  27.46 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0943  putative signal transduction protein with CBS domains  27.66 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2357  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  23.31 
 
 		 435 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.889148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1822  CBS domain containing protein  26.72 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3340  CBS domain containing protein  24.59 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762759  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  26.83 
 
 		 689 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  19.57 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  21.48 
 
 		 880 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  22 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1687  putative transcriptional regulator, XRE family  25.21 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  25.27 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2685  signal transduction protein  25.19 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.209094  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.14 
 
 		 903 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  25.2 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  22.05 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  19.7 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  23.28 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1761  DRTGG domain-containing protein  23.08 
 
 		 432 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540009  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0948  CBS domain containing membrane protein  23.53 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1795  DRTGG domain-containing protein  23.08 
 
 		 432 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  24.65 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  24.39 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  27.83 
 
 		 161 aa  43.9  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2408  CBS domain-containing protein  23.97 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3810  signal transduction protein  27.56 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2120  CBS domain-containing protein  23.97 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  23.65 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  24.49 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  21.43 
 
 		 398 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  25.53 
 
 		 769 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  22.41 
 
 		 904 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  22.88 
 
 		 875 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2695  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  24.48 
 
 		 438 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  28.07 
 
 		 144 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  27.69 
 
 		 863 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  22.79 
 
 		 226 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  20.31 
 
 		 427 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 279 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  24.81 
 
 		 242 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  22.81 
 
 		 291 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  24.26 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  23.28 
 
 		 909 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  24.3 
 
 		 888 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  26.5 
 
 		 249 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  26.71 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  27.05 
 
 		 219 aa  40.8  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.12 
 
 		 499 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  22.46 
 
 		 903 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1268  CBS domain-containing protein  25.17 
 
 		 432 aa  40.4  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  21.43 
 
 		 202 aa  40.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  22.31 
 
 		 142 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  25.93 
 
 		 180 aa  40.4  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>