41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0750 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  441  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  41.67 
 
 
227 aa  178  7e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0432  hypothetical protein  28.04 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000142024  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  29.86 
 
 
230 aa  85.1  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  25.59 
 
 
225 aa  85.1  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2000  hypothetical protein  29.65 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  27.32 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1559  hypothetical protein  32.14 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  22.9 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  24.08 
 
 
243 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  25.34 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  23.11 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  25.12 
 
 
224 aa  59.7  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0874  hypothetical protein  26.06 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  25.45 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0548  protein of unknown function DUF1275  22.39 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  24.89 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  24.89 
 
 
248 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  24.89 
 
 
248 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  24.47 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  24.47 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  24.47 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  24.47 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  24.47 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  24.47 
 
 
246 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  24.55 
 
 
240 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  22.46 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  23.53 
 
 
273 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1270  protein of unknown function DUF1275  23.66 
 
 
230 aa  51.6  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  24.47 
 
 
246 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  24.89 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  23.53 
 
 
282 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  24.1 
 
 
240 aa  47  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  25.76 
 
 
241 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  24.86 
 
 
225 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  25 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  26.18 
 
 
658 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  25 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  24.59 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  25.76 
 
 
255 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  23.44 
 
 
213 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>