23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21960 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_21960  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 407 aa  757    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 415 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6955  hypothetical protein  34.46 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 437 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  32.7 
 
 		 530 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  22.03 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 401 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  25.55 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  26.9 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  22.3 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 441 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 524 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>