More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11410 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  100 
 
 		 262 aa  495  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  62.45 
 
 		 260 aa  301  6.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  61.54 
 
 		 264 aa  288  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  54.69 
 
 		 286 aa  258  7e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0959  hypothetical protein  68.26 
 
 		 259 aa  251  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.170118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  58.5 
 
 		 264 aa  248  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  59.85 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  55.08 
 
 		 279 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  54.02 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0553  protein of unknown function DUF81  57.2 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  48.96 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  48.96 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  47.97 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  48.33 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  48.75 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  46.25 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  47.56 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  47.54 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  40 
 
 		 263 aa  189  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  46.67 
 
 		 252 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  45.38 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  45.49 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  48.8 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  44.81 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  45.8 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  49.2 
 
 		 253 aa  184  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  45.76 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  44.58 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06970  predicted permease  50.78 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497367  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  47.15 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  38.33 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  47.92 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  43.53 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  44.58 
 
 		 252 aa  174  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  39.84 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  46.03 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  47.43 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  39.44 
 
 		 255 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  37.19 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  39.04 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  38.78 
 
 		 256 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  39.36 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1208  protein of unknown function DUF81  50.22 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  38.43 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  38.15 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  38.15 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  38.17 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  39.2 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  38.78 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  44.68 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  38.78 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  38.17 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  38.78 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  38.78 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  38.78 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  49.36 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  38.17 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  39.04 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  37.76 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  39.36 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  38.96 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  38.04 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  38.04 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1793  hypothetical protein  46.19 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.607565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  36.11 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  36.11 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  36.11 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2578  hypothetical protein  45.45 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  37.5 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  40.97 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  35.97 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  35.6 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  33.85 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  34.92 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  34.92 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  34.92 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  34.92 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  36.84 
 
 		 268 aa  142  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  36.84 
 
 		 268 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  36.84 
 
 		 268 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  34.92 
 
 		 269 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  38.02 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  36.44 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2209  protein of unknown function DUF81  45.02 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000506184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  37.4 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  36.29 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  35.22 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  32.18 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  36.94 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  36.5 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  35.29 
 
 		 269 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  35.29 
 
 		 269 aa  135  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  34.45 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  35.88 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  34.87 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  34.87 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  35.88 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  34.87 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  35.71 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>