86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3837 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
204 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  44.67 
 
 
329 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  42.5 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  43 
 
 
324 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  41.18 
 
 
376 aa  111  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  54.92 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  41.15 
 
 
348 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  43.65 
 
 
343 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  43.3 
 
 
361 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  43.15 
 
 
298 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  42.86 
 
 
361 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  36.92 
 
 
318 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.92 
 
 
318 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  42.35 
 
 
270 aa  90.5  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  36.13 
 
 
320 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  36.41 
 
 
318 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  37.7 
 
 
320 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  40.54 
 
 
351 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  39.89 
 
 
347 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  38.2 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  39.9 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  34.25 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  40.91 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  41.54 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  31.61 
 
 
368 aa  74.7  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  27.72 
 
 
263 aa  52  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  29.19 
 
 
202 aa  51.6  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  29.03 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  23.12 
 
 
216 aa  49.3  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1242  GDSL family lipase  31.07 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  normal  0.178592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  32.29 
 
 
256 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  32.65 
 
 
210 aa  48.5  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  30.46 
 
 
244 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  27.8 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  35.56 
 
 
244 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  29.25 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  32.76 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  29.32 
 
 
225 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  35.56 
 
 
244 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.56 
 
 
244 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.56 
 
 
244 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  35.75 
 
 
267 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  31.22 
 
 
203 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  35.75 
 
 
267 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  29.25 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  30.53 
 
 
283 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  31.38 
 
 
255 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  36.76 
 
 
223 aa  45.4  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.35 
 
 
218 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  27.42 
 
 
281 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  28.79 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  34.93 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  35.78 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  31.05 
 
 
296 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  25.13 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  30.61 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.24 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  29.8 
 
 
294 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  29.92 
 
 
302 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  33.9 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  26.53 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  26.34 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  28.02 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  26.37 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  31.38 
 
 
235 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  30.3 
 
 
287 aa  42.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  25.82 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  33.69 
 
 
270 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.79 
 
 
270 aa  42.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  26.15 
 
 
244 aa  42.4  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1815  acyl-CoA thioesterase I precursor  27.78 
 
 
216 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2714  lipolytic protein  27.6 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345336 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  25.39 
 
 
225 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  32.79 
 
 
261 aa  42  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  32.76 
 
 
249 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  24.87 
 
 
201 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  32.16 
 
 
223 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  34.07 
 
 
235 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  32.76 
 
 
240 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  23.23 
 
 
266 aa  42  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.06 
 
 
258 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  29.06 
 
 
256 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2271  GDSL family lipase  29.95 
 
 
215 aa  41.2  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1603  lipolytic protein G-D-S-L family  29.95 
 
 
215 aa  41.2  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  29.06 
 
 
256 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>