33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2799 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  789    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  43.79 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  36.9 
 
 		 423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  34.54 
 
 		 427 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  34.54 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  39.85 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  32.92 
 
 		 414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  35.84 
 
 		 391 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  33.76 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  39.05 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  35.53 
 
 		 472 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  35.53 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  32.73 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  35.67 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  35.4 
 
 		 404 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  32.73 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  40.76 
 
 		 394 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  35.89 
 
 		 461 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  39.83 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  31.74 
 
 		 401 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 474 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  28.73 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  29.06 
 
 		 401 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  28.5 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  29.79 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  28.21 
 
 		 366 aa  69.7  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  28.33 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  26.87 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  26.84 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  27.2 
 
 		 384 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0358  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  29.37 
 
 		 357 aa  46.6  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02731  undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-UDPGlcNAc GlcNAc transferase  25.88 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1564  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  25.88 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>