75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1375 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  100 
 
 
318 aa  648    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.015073  normal  0.0495173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17440  Lauroyl/myristoyl acyltransferase  55.63 
 
 
317 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0985707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1786  lipid A biosynthesis acyltransferase  52.63 
 
 
337 aa  291  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  normal  0.0660981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1659  lipid A biosynthesis acyltransferase  48.88 
 
 
326 aa  280  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1982  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.04 
 
 
328 aa  250  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.859869  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  41.53 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  41.28 
 
 
404 aa  198  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  39.32 
 
 
320 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  38.95 
 
 
307 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  37.8 
 
 
304 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  38.56 
 
 
311 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2102  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  40.6 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.995802  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  38.46 
 
 
328 aa  163  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  34.67 
 
 
317 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.02 
 
 
314 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.47 
 
 
310 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.67 
 
 
310 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  34.92 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1363  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  34.68 
 
 
292 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.698598  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.85 
 
 
307 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.85 
 
 
307 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.85 
 
 
307 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  34.44 
 
 
286 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  35.64 
 
 
303 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2344  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.56 
 
 
355 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.58 
 
 
300 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  32.91 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12630  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  38.52 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.97 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2290  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.58 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146974  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.96 
 
 
234 aa  99  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.18 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.34 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  25.09 
 
 
306 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.91 
 
 
319 aa  62.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.82 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.09 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.42 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.5 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.38 
 
 
281 aa  58.9  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.39 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.92 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.27 
 
 
312 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  19.18 
 
 
304 aa  56.2  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  20.73 
 
 
307 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.98 
 
 
295 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.66 
 
 
298 aa  55.8  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.26 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3368  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.58 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00130747  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.98 
 
 
295 aa  53.9  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.08 
 
 
295 aa  52.8  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.9 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1676  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.6 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.480087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.55 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  21.43 
 
 
281 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  21.43 
 
 
281 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.64 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  23.81 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.37 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.5 
 
 
296 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5158  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.41 
 
 
308 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.42 
 
 
288 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.18 
 
 
306 aa  45.8  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.26 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2076  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.29 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.69 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.7 
 
 
308 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  29.41 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  29.71 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.65 
 
 
287 aa  43.9  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.67 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.89 
 
 
309 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4887  lipid A biosynthesis acyltransferase  19.27 
 
 
289 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231299  normal  0.44297 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.12 
 
 
294 aa  42.7  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0082  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000070481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>