More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0008 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2122  Propionyl-CoA carboxylase  77.73 
 
 
625 aa  956    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.893863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 
607 aa  1232    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2913  Propionyl-CoA carboxylase  83.08 
 
 
586 aa  885    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.615692  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2454  carboxyl transferase  72.48 
 
 
612 aa  882    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  47.57 
 
 
520 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.72 
 
 
517 aa  505  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  48.91 
 
 
518 aa  502  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  48.05 
 
 
513 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  47.67 
 
 
513 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  47.86 
 
 
513 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2332  propionyl-CoA carboxylase  47.86 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  47.49 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  47.86 
 
 
513 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  47.47 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  47.47 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  47.67 
 
 
513 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  47.67 
 
 
513 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  47.47 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  46.55 
 
 
523 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2164  propionyl-CoA carboxylase  46.18 
 
 
522 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.207678  normal  0.196324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  45.73 
 
 
508 aa  456  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2212  Propionyl-CoA carboxylase  46.08 
 
 
513 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2300  Sigma 54 interacting domain protein  46.27 
 
 
513 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.535149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1646  propionyl-CoA carboxylase  45.42 
 
 
524 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  44.74 
 
 
510 aa  443  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  44.58 
 
 
510 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  43.58 
 
 
506 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08220  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  44.07 
 
 
537 aa  431  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0033  propionyl-CoA carboxylase  43.56 
 
 
510 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  38.61 
 
 
508 aa  365  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  38.43 
 
 
531 aa  364  3e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  40.3 
 
 
525 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  38.78 
 
 
515 aa  360  4e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  38.78 
 
 
515 aa  360  5e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  38.3 
 
 
514 aa  353  5e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  37.19 
 
 
516 aa  353  5.9999999999999994e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  38.63 
 
 
514 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  36.33 
 
 
518 aa  349  8e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  36.74 
 
 
516 aa  348  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  37.07 
 
 
516 aa  347  4e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  37.91 
 
 
514 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  37.57 
 
 
551 aa  344  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  38.08 
 
 
531 aa  342  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  36.81 
 
 
531 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  37 
 
 
516 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  39.53 
 
 
513 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  37.2 
 
 
512 aa  339  7e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  35.11 
 
 
516 aa  339  7e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  37.4 
 
 
527 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  35.59 
 
 
512 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  35.33 
 
 
514 aa  337  5.999999999999999e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  35.63 
 
 
512 aa  335  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  36.53 
 
 
520 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  36.61 
 
 
513 aa  334  3e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  36.99 
 
 
513 aa  334  3e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  35.63 
 
 
516 aa  333  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  35.63 
 
 
516 aa  333  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  35.04 
 
 
517 aa  332  1e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  35.96 
 
 
522 aa  332  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  36.83 
 
 
527 aa  332  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  35.91 
 
 
518 aa  330  4e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  37.74 
 
 
527 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  36.29 
 
 
532 aa  327  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  37.06 
 
 
521 aa  326  6e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  35.69 
 
 
542 aa  326  6e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  35.83 
 
 
513 aa  326  6e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  37.08 
 
 
538 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  38.11 
 
 
518 aa  325  1e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  35.92 
 
 
524 aa  326  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  36.05 
 
 
519 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  36.05 
 
 
519 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  36.08 
 
 
516 aa  325  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  35.03 
 
 
511 aa  324  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  37.23 
 
 
530 aa  324  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  35.9 
 
 
510 aa  323  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  35.7 
 
 
522 aa  323  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2771  carboxyl transferase  36.01 
 
 
549 aa  323  7e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  36.05 
 
 
519 aa  323  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  37.08 
 
 
514 aa  322  9.000000000000001e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  35.43 
 
 
517 aa  322  9.000000000000001e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  36.63 
 
 
522 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0201  carboxyl transferase  35.21 
 
 
521 aa  322  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0217258  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  35.88 
 
 
517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  34.73 
 
 
514 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  36.6 
 
 
550 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  36.07 
 
 
513 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  35.56 
 
 
517 aa  321  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  34.58 
 
 
556 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  34.58 
 
 
556 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  34.58 
 
 
556 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  35.76 
 
 
564 aa  319  7e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  35.11 
 
 
510 aa  320  7e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  34.08 
 
 
538 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  35.48 
 
 
514 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  35.62 
 
 
520 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  34.71 
 
 
510 aa  318  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  36.96 
 
 
514 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  35.89 
 
 
522 aa  317  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  34.65 
 
 
510 aa  317  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  35.42 
 
 
519 aa  316  7e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>