More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_19850 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  100 
 
 
595 aa  1202    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  40.97 
 
 
597 aa  435  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
585 aa  253  6e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  29.86 
 
 
569 aa  226  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  40.73 
 
 
488 aa  212  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  38.98 
 
 
516 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  30.66 
 
 
577 aa  198  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  31.79 
 
 
567 aa  193  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  31.32 
 
 
603 aa  193  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  35.23 
 
 
604 aa  191  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
580 aa  190  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  25.46 
 
 
597 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  33.87 
 
 
604 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  30.43 
 
 
603 aa  171  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  34.11 
 
 
589 aa  170  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  35.87 
 
 
612 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  32.47 
 
 
600 aa  160  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  31.97 
 
 
627 aa  160  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  31.33 
 
 
583 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  29.09 
 
 
600 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
502 aa  154  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  31.02 
 
 
583 aa  154  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  36.36 
 
 
594 aa  151  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 
640 aa  150  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  31.76 
 
 
495 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  36.7 
 
 
414 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3033  histidine kinase internal region  28.96 
 
 
633 aa  148  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0284117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  29.55 
 
 
587 aa  146  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  30.35 
 
 
599 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  36.32 
 
 
576 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  38.03 
 
 
578 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  30.63 
 
 
610 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  34.42 
 
 
455 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  27.73 
 
 
498 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  28.62 
 
 
564 aa  130  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  28.8 
 
 
600 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
483 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1393  histidine kinase internal region  30 
 
 
586 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  34.11 
 
 
411 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  30.34 
 
 
578 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
578 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  27.74 
 
 
623 aa  128  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
576 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  30.42 
 
 
391 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  26.91 
 
 
574 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3857  signal transduction histidine kinase, LytS  27 
 
 
581 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000136608  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2372  histidine kinase internal region  29.06 
 
 
595 aa  124  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  31.4 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  30.04 
 
 
374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  29.31 
 
 
394 aa  122  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 
465 aa  122  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  32.2 
 
 
363 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  32.72 
 
 
450 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1646  putative sensor with HAMP domain  25.78 
 
 
617 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177984  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  32.02 
 
 
568 aa  120  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  30.2 
 
 
394 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  28.87 
 
 
402 aa  120  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0617  signal transduction histidine kinase, LytS  27.86 
 
 
601 aa  120  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3281  signal transduction histidine kinase, LytS  36.86 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  33.81 
 
 
576 aa  119  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  33.48 
 
 
403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  31.4 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  32.51 
 
 
398 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  30.17 
 
 
394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  31.4 
 
 
409 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  26.85 
 
 
603 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  29.6 
 
 
408 aa  116  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  32.55 
 
 
426 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  30.33 
 
 
580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  27.17 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  31.5 
 
 
338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  33.63 
 
 
410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  32.57 
 
 
557 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  32.57 
 
 
557 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  32.89 
 
 
410 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.99 
 
 
557 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  33.99 
 
 
557 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  33.99 
 
 
557 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  33.99 
 
 
557 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  30.66 
 
 
400 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  29.28 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  31.39 
 
 
568 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  28.95 
 
 
408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  32.1 
 
 
446 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0918  histidine kinase  31.82 
 
 
443 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  31.4 
 
 
403 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  28.33 
 
 
440 aa  111  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  31.4 
 
 
403 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  31.4 
 
 
403 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  30.24 
 
 
393 aa  111  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1250  signal transduction histidine kinase, LytS  30.15 
 
 
574 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.888178  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  29.52 
 
 
405 aa  110  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  29.36 
 
 
428 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  30 
 
 
561 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  30 
 
 
561 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  30 
 
 
561 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  30 
 
 
561 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  30 
 
 
561 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  28.84 
 
 
594 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1112  sensor histidine kinase  29.09 
 
 
574 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0193784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>