53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15600 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15600  Rubrerythrin  100 
 
 
141 aa  285  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1879  rubrerythrin  70.59 
 
 
140 aa  194  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000143668  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0458  rubrerythrin  59.42 
 
 
139 aa  165  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.79007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2476  rubrerythrin  60 
 
 
140 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000982174  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0954  rubrerythrin  63.77 
 
 
140 aa  158  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1532  rubrerythrin  56.52 
 
 
139 aa  156  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0387  rubrerythrin  56.52 
 
 
139 aa  154  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0449  rubrerythrin  56.52 
 
 
139 aa  153  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1108  Rubrerythrin  60.29 
 
 
143 aa  146  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.666656  normal  0.376082 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  47.92 
 
 
180 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  46.53 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  46.53 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  47.22 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  46.53 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  45.83 
 
 
180 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4567  Rubrerythrin  48.94 
 
 
181 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.02567e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  47.52 
 
 
181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3505  rubrerythrin  46.1 
 
 
180 aa  123  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000134331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  45.07 
 
 
181 aa  120  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  45.14 
 
 
180 aa  110  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2434  rubrerythrin  51.67 
 
 
124 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0902  Rubrerythrin  52.07 
 
 
181 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1596  hypothetical protein  46.67 
 
 
127 aa  93.6  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  32.39 
 
 
228 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  27.54 
 
 
191 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  31.93 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  32.84 
 
 
180 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  29.86 
 
 
143 aa  47  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  33.96 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  33.9 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  32.46 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  38.89 
 
 
166 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  30.36 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  33.33 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  32.03 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  30.43 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  37.5 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  38.36 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  39.39 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  36.25 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  38.36 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  28.79 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  35.62 
 
 
166 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  32.14 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  30.71 
 
 
179 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  28.47 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  30.15 
 
 
233 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  31.53 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  39.39 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  38.57 
 
 
392 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  36.36 
 
 
166 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  29.66 
 
 
167 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  28.57 
 
 
168 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>