92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_02080 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_02080  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  163  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0425  hypothetical protein  38.96 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  37.5 
 
 
667 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  38.67 
 
 
653 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  41.77 
 
 
645 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  41.77 
 
 
645 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0753  hypothetical protein  34.21 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000530744 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0431  hypothetical protein  35.9 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0558  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  32.93 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.808339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0342  NADH dehydrogenase I, E subunit  32.1 
 
 
173 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.702916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  34.18 
 
 
666 aa  50.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0338  NADH dehydrogenase (quinone)  33.8 
 
 
573 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3351  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  30.68 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.044773 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0319  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  30.99 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13170  NADH dehydrogenase subunit E  35.06 
 
 
252 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1369  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  30.49 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0660  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  36.71 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1317  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30.49 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1846  NADP-reducing hydrogenase chain A  32.93 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1602  NADP-reducing hydrogenase chain A  31.71 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_634  [Fe] hydrogenase, HymA subunit  35.44 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0837  hypothetical protein  33.33 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00554204  hitchhiker  0.000686175 
 
 
-
 
NC_002936  DET0728  [Fe] hydrogenase, HymA subunit, putative  35.44 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1636  NADP-reducing hydrogenase chain A  31.71 
 
 
172 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000374752  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  35.06 
 
 
263 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2098  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  37.66 
 
 
186 aa  47.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.380739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  35.14 
 
 
287 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  33.77 
 
 
253 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0543  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.46 
 
 
269 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1719  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.33 
 
 
157 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.71494  normal  0.464231 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2301  hypothetical protein  33.78 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.962162  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3134  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.76 
 
 
171 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0282366  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  31.25 
 
 
166 aa  46.2  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4240  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  29.55 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0470  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  28.4 
 
 
156 aa  47  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000044174  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  31.25 
 
 
269 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.77 
 
 
248 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_766  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit F subfamily  39.39 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0428  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  31.33 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  36.76 
 
 
659 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.1 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0176  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.71 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0227  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.87 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00462802  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0492  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  30.49 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8359  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.86 
 
 
567 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5227  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.86 
 
 
572 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00138692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0093  hypothetical protein  36.36 
 
 
80 aa  43.5  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0863  hydrogenase subunit HymA, putative  37.88 
 
 
161 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0781  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  38.1 
 
 
161 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01790  NADH dehydrogenase I subunit E  32.14 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2577  dehydrogenase subunit, putative  30.56 
 
 
561 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  31.65 
 
 
570 aa  42.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3925  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  30 
 
 
562 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4260  NADH dehydrogenase 24 kDa subunit  31.08 
 
 
150 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  27.16 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.77 
 
 
240 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3518  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  28.4 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  35.14 
 
 
239 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  32.5 
 
 
239 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1314  hypothetical protein  27.03 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000587692  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1576  NADH dehydrogenase subunit E  28.4 
 
 
294 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.685824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1600  NADH dehydrogenase subunit E  28.4 
 
 
294 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.737975  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1546  NADH dehydrogenase subunit E  28.4 
 
 
294 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.132733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2703  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  31.58 
 
 
151 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0473  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.68 
 
 
302 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1281  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.43 
 
 
565 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.532683  normal  0.302449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0089  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  28.92 
 
 
161 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0240051  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  31.33 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  31.33 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  26.98 
 
 
623 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02960  NADH dehydrogenase I subunit E  35.71 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4006  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.11 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7952e-27 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1295  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.33 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2142  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  24.1 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0495  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  24.32 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  33.33 
 
 
666 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30.67 
 
 
162 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4049  hypothetical protein  25.71 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  27.5 
 
 
230 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0992  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  29.11 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  25.97 
 
 
188 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1273  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  27.38 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.308673  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4652  NADH dehydrogenase (quinone)  27.14 
 
 
580 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198503  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  29.73 
 
 
388 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  29.73 
 
 
388 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0588  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  30 
 
 
219 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.1 
 
 
294 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3922  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  27.85 
 
 
169 aa  40  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  32.47 
 
 
706 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  29.73 
 
 
385 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1702  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit NuoE  29.63 
 
 
166 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  25.81 
 
 
623 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>