26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0093 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0093  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0753  hypothetical protein  55.7 
 
 		 79 aa  106  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000530744 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0425  hypothetical protein  53.16 
 
 		 81 aa  97.1  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0837  hypothetical protein  45.45 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00554204  hitchhiker  0.000686175 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3462  hypothetical protein  48.05 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2301  hypothetical protein  44.3 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.962162  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0431  hypothetical protein  42.31 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0319  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  54.1 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1314  hypothetical protein  41.25 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000587692  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1372  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  41.89 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4049  hypothetical protein  34.25 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0495  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  35.21 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1832  hypothetical protein  35.59 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0324574  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0086  hypothetical protein  28.81 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  45.65 
 
 		 653 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  42.22 
 
 		 645 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  42.22 
 
 		 645 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 		 530 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02080  hypothetical protein  36.36 
 
 		 80 aa  43.5  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  37.78 
 
 		 667 aa  42  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  32.31 
 
 		 659 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1845  hypothetical protein  37.93 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  31.37 
 
 		 535 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  31.48 
 
 		 666 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  31.37 
 
 		 535 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  32.39 
 
 		 535 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>