51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0319 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0319  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  100 
 
 		 96 aa  186  9e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0425  hypothetical protein  47.89 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0093  hypothetical protein  54.1 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0495  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  42.86 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  40.74 
 
 		 666 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2301  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.962162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4049  hypothetical protein  39.71 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1314  hypothetical protein  45.59 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000587692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0837  hypothetical protein  34.78 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00554204  hitchhiker  0.000686175 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  33.8 
 
 		 645 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  33.8 
 
 		 645 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0753  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000530744 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  37.33 
 
 		 653 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1372  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  46.77 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1832  hypothetical protein  40.54 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0324574  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  35.62 
 
 		 667 aa  54.3  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1845  hypothetical protein  36 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0431  hypothetical protein  31.58 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02080  hypothetical protein  30.99 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3462  hypothetical protein  42.25 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  27.16 
 
 		 666 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0728  [Fe] hydrogenase, HymA subunit, putative  28.21 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0660  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  29.49 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_634  [Fe] hydrogenase, HymA subunit  28.21 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3292  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  27.71 
 
 		 177 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.33 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  30.77 
 
 		 623 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1475  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  30.43 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_766  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit F subfamily  36.07 
 
 		 161 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.25 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0227  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30.86 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00462802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0342  NADH dehydrogenase I, E subunit  22.5 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.702916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2805  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  28.75 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.327427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4240  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  22.5 
 
 		 168 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  32.86 
 
 		 535 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3351  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  22.5 
 
 		 173 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.044773 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  32.86 
 
 		 535 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3831  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  20.45 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0863  hydrogenase subunit HymA, putative  36.21 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1886  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.08 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1449  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  27.5 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292032  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0781  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  36.21 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  34.48 
 
 		 659 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0617  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  23.46 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  27.59 
 
 		 636 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3638  formate dehydrogenase subunit gamma  24 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  27.59 
 
 		 636 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1295  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  26.76 
 
 		 160 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3927  formate dehydrogenase subunit gamma  23.86 
 
 		 159 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0558  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  26.51 
 
 		 161 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.808339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24660  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit  27.59 
 
 		 162 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>