53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_R0021 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148955  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0049  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0048  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.889527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0051  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0043  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0046  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531396  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0045  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0066  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0635927  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0051  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0044  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152899 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>