270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6798 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6798  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 276 aa  531  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  41.57 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.52 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  34.9 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  36.08 
 
 		 271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  37.74 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.96 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  35.41 
 
 		 268 aa  128  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  38.19 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.33 
 
 		 271 aa  125  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.74 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  32.85 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.27 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1361  cytochrome c assembly protein  37.31 
 
 		 284 aa  98.6  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1458  cytochrome c assembly protein  37.31 
 
 		 284 aa  98.6  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2494  cytochrome c assembly protein  36.13 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  30.8 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  30.29 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  29.92 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.62 
 
 		 284 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  30.59 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.57 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  32.09 
 
 		 283 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.57 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  27.1 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.83 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.24 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.69 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  30.54 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3088  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.01 
 
 		 360 aa  87  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  33.5 
 
 		 366 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  33.5 
 
 		 366 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  33.5 
 
 		 366 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  32.8 
 
 		 366 aa  86.7  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  31.32 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1373  cytochrome c assembly protein  34.08 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3289  cytochrome c assembly protein  32.52 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.65 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  32.67 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0591  cytochrome c assembly protein  25.4 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  32.37 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2565  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.989453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  31.65 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  32.12 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  28.65 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  31.65 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  28.65 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  31.65 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  28.65 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  31.55 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.5 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4556  hemX protein  27.1 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4362  hemX protein  27.1 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4198  hemX protein  27.1 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4209  hemX protein  27.1 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0297  cytochrome c assembly protein  28.85 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4601  hemX protein  27.1 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4697  hemX protein  27.1 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4552  hemX protein  27.1 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  28.11 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.77 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.94 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.78 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  30.94 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  30.22 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4310  cytochrome c assembly protein  27.1 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  31 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  31.47 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4583  hemX protein  27.1 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.91 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3181  cytochrome c assembly protein  26.67 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.02 
 
 		 454 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.43 
 
 		 390 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.92 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.79 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  27.94 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  31.74 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0651  hemX protein  26.64 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0579  cytochrome c assembly protein  29.02 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1617  cytochrome c assembly protein  30.08 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.935625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.5 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.98 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.85 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  29.58 
 
 		 397 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  30.46 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.61 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.82 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  27.52 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1749  cytochrome c assembly protein  28.85 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  36.49 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  33.08 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  33.83 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  30.81 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  30.32 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  29.41 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.73 
 
 		 395 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.78 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  29.56 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.19 
 
 		 395 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.03 
 
 		 405 aa  67  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>