More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6160 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
438 aa  850    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  47.48 
 
 
434 aa  359  7e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  42.69 
 
 
438 aa  347  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  43.57 
 
 
463 aa  338  9e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  37.35 
 
 
1833 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  38.39 
 
 
1816 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 
432 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 
432 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  37.23 
 
 
445 aa  295  7e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  43.8 
 
 
449 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  43.07 
 
 
449 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 
499 aa  279  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.11 
 
 
1829 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  40.86 
 
 
495 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  31.91 
 
 
439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  39.55 
 
 
1876 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  37.89 
 
 
454 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  40.63 
 
 
448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  38.08 
 
 
432 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  31.16 
 
 
448 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.19 
 
 
1864 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 
434 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 
434 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  33.06 
 
 
414 aa  221  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.72 
 
 
1839 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.34 
 
 
1806 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  31.09 
 
 
441 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  37.4 
 
 
1769 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.21 
 
 
1776 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.98 
 
 
2720 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  35.39 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  35.71 
 
 
430 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 
433 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 
437 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  32.16 
 
 
927 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.16 
 
 
927 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  32.16 
 
 
927 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  32.16 
 
 
927 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  32.16 
 
 
927 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.16 
 
 
927 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.16 
 
 
927 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  30.39 
 
 
472 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
415 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  28.86 
 
 
425 aa  139  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1968  major facilitator transporter  32.65 
 
 
461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 
458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
440 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.9 
 
 
390 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.9 
 
 
390 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
412 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  32.27 
 
 
411 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  31.27 
 
 
411 aa  123  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  26.75 
 
 
422 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  25.45 
 
 
414 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.76 
 
 
422 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  29.62 
 
 
405 aa  117  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  25.89 
 
 
422 aa  117  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  30.08 
 
 
394 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  26.6 
 
 
397 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  25.12 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  25.75 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  24.49 
 
 
415 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 
439 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  24.49 
 
 
417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  25.75 
 
 
422 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  25.75 
 
 
422 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
407 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  25.45 
 
 
414 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.07 
 
 
412 aa  112  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  24.1 
 
 
422 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.5 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  25 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  25.7 
 
 
415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  28.39 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  23.99 
 
 
417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  24.24 
 
 
415 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  24.24 
 
 
417 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  25.44 
 
 
422 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.81 
 
 
418 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  21.81 
 
 
412 aa  107  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  26.29 
 
 
397 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  25.45 
 
 
414 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1086  major facilitator superfamily protein  38.64 
 
 
134 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  27.62 
 
 
408 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  26.08 
 
 
423 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.53 
 
 
408 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  30.21 
 
 
450 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  20.91 
 
 
434 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1259  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 
445 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  20.47 
 
 
434 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  20.4 
 
 
434 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  27.75 
 
 
428 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  20.47 
 
 
434 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  27.35 
 
 
408 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  20.21 
 
 
434 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  20.15 
 
 
434 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>