More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3920 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3920  ABC transporter related protein  100 
 
 		 264 aa  520  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.197933 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  33.65 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  34.16 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  33.07 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  37.1 
 
 		 273 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  32.67 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  32.67 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  39.25 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  33.07 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  33.07 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0130  ABC transporter related protein  33.48 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  33.07 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  32.93 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  43.13 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  32.41 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  32.68 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  32.68 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  32.02 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1536  ABC transporter related  42.18 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.591155 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  40.47 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  31.2 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  31.73 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  35.93 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0439  ABC transporter related  32.04 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0164474  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.41 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  31.76 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  32.89 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  32.41 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  32.66 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  29.57 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  31.33 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  32.27 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  32.27 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  30.08 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  32.24 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  31.37 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  32.24 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  40 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  31.85 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  31.08 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  32.24 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  32.24 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  30.49 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2087  ABC transporter related  35.37 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  33.06 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  34.02 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  40.76 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  38.39 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  35.22 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  31.43 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  31.43 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  31.43 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  31.43 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  31.43 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5659  ABC transporter-like  38.28 
 
 		 222 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878914  normal  0.0991539 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  31.43 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  31.43 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  31.43 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18240  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  38.92 
 
 		 226 aa  122  8e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  36.82 
 
 		 294 aa  122  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  38.1 
 
 		 243 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  38.1 
 
 		 243 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  31.45 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  37.9 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  32.18 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  31.02 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  42.03 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  36.67 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  31.02 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  33.33 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  33.33 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  34.76 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  29.27 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  33.33 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  34.51 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  29.84 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  36.95 
 
 		 273 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  33.73 
 
 		 262 aa  119  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  37.26 
 
 		 262 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  33.62 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  28.23 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  35.68 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  34.25 
 
 		 288 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  31.25 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4293  ABC transporter related  36.89 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  36.06 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0414  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  32.87 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  35 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  27.78 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3525  ABC transporter related  37.07 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0279  ABC transporter related  32.93 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343631  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  36.68 
 
 		 271 aa  115  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  31.92 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  34.55 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  31.76 
 
 		 296 aa  115  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  33.06 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>